19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2481 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2481  hypothetical protein  100 
 
 
274 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.287343 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2260  hypothetical protein  76.19 
 
 
279 aa  447  1e-125  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.087732 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0407  hypothetical protein  66.06 
 
 
279 aa  385  1e-106  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0332  hypothetical protein  60.58 
 
 
278 aa  350  2e-95  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1049  hypothetical protein  40.17 
 
 
232 aa  176  3e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.931099  normal  0.654081 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1649  hypothetical protein  41.03 
 
 
274 aa  169  5e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.140534  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0039  hypothetical protein  43.49 
 
 
267 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3174  hypothetical protein  38.1 
 
 
273 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1376  hypothetical protein  36.4 
 
 
273 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59451  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1527  hypothetical protein  35.69 
 
 
250 aa  142  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2893  hypothetical protein  36.76 
 
 
272 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.362582  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0116  protein of unknown function DUF169  36.06 
 
 
265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011799  hitchhiker  0.00705283 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2252  protein of unknown function DUF169  28.04 
 
 
238 aa  103  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1444  protein of unknown function DUF169  24.45 
 
 
281 aa  59.3  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0915  hypothetical protein  26.57 
 
 
258 aa  57.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.155446  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2166  protein of unknown function DUF169  23.02 
 
 
281 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2491  hypothetical protein  25.18 
 
 
296 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.785012  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0320  protein of unknown function DUF169  24.01 
 
 
284 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.129666  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2533  hypothetical protein  26.03 
 
 
285 aa  49.3  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>