22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0915 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0915  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  530  1e-149  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.155446  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2533  hypothetical protein  35.05 
 
 
285 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0320  protein of unknown function DUF169  34.6 
 
 
284 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.129666  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1527  hypothetical protein  34.45 
 
 
250 aa  124  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1444  protein of unknown function DUF169  35.85 
 
 
281 aa  123  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2491  hypothetical protein  31.47 
 
 
296 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.785012  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2166  protein of unknown function DUF169  34.12 
 
 
281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2252  protein of unknown function DUF169  30.88 
 
 
238 aa  105  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0039  hypothetical protein  35.56 
 
 
267 aa  104  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0116  protein of unknown function DUF169  32.97 
 
 
265 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011799  hitchhiker  0.00705283 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1649  hypothetical protein  35.33 
 
 
274 aa  84  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.140534  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3174  hypothetical protein  33.55 
 
 
273 aa  82.8  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2893  hypothetical protein  31.17 
 
 
272 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.362582  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0406  hypothetical protein  27.86 
 
 
257 aa  79.3  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1376  hypothetical protein  30.52 
 
 
273 aa  75.1  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59451  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2259  hypothetical protein  25.34 
 
 
260 aa  72  0.000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0386104 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3015  hypothetical protein  28.65 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.667221  normal  0.0266748 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2260  hypothetical protein  26.7 
 
 
279 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.087732 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0407  hypothetical protein  27.03 
 
 
279 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2481  hypothetical protein  26.57 
 
 
274 aa  57.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.287343 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1049  hypothetical protein  30.46 
 
 
232 aa  57.8  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.931099  normal  0.654081 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0332  hypothetical protein  23.77 
 
 
278 aa  50.1  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>