19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2260 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2260  hypothetical protein  100 
 
 
279 aa  572  1.0000000000000001e-162  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.087732 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2481  hypothetical protein  76.19 
 
 
274 aa  447  1e-125  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.287343 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0407  hypothetical protein  71.79 
 
 
279 aa  424  1e-118  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0332  hypothetical protein  67.51 
 
 
278 aa  377  1e-103  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1049  hypothetical protein  39.66 
 
 
232 aa  176  3e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.931099  normal  0.654081 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1649  hypothetical protein  39.93 
 
 
274 aa  167  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.140534  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0039  hypothetical protein  39.85 
 
 
267 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3174  hypothetical protein  38.41 
 
 
273 aa  154  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1376  hypothetical protein  38.52 
 
 
273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59451  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1527  hypothetical protein  36.8 
 
 
250 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0116  protein of unknown function DUF169  39.55 
 
 
265 aa  149  6e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011799  hitchhiker  0.00705283 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2893  hypothetical protein  38.27 
 
 
272 aa  145  5e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.362582  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2252  protein of unknown function DUF169  28.46 
 
 
238 aa  106  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1444  protein of unknown function DUF169  26.95 
 
 
281 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2491  hypothetical protein  26.45 
 
 
296 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.785012  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0915  hypothetical protein  26.7 
 
 
258 aa  64.7  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.155446  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2166  protein of unknown function DUF169  25.11 
 
 
281 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2533  hypothetical protein  22.75 
 
 
285 aa  55.8  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0320  protein of unknown function DUF169  25.64 
 
 
284 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.129666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>