14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0066 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0066  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  249  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22710  hypothetical protein  50 
 
 
149 aa  91.7  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1616  hypothetical protein  48.67 
 
 
123 aa  73.6  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.837704 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3391  hypothetical protein  42.86 
 
 
128 aa  56.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0135  hypothetical protein  39.29 
 
 
135 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0688189 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1545  Polyketide cyclase/dehydrase  34.82 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0145  hypothetical protein  33.07 
 
 
132 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.510568  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0154  hypothetical protein  33.07 
 
 
132 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1118  hypothetical protein  43.59 
 
 
141 aa  47.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.222557  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2322  hypothetical protein  40.58 
 
 
132 aa  47.4  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2710  hypothetical protein  29.06 
 
 
118 aa  44.7  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0283018 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0158  hypothetical protein  34.29 
 
 
128 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0510  hypothetical protein  34.29 
 
 
126 aa  42.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.319441  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3938  hypothetical protein  30.39 
 
 
136 aa  40.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0590481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>