More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3361 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0332  leucyl aminopeptidase  65.23 
 
 
496 aa  642    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00199325  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3361  leucyl aminopeptidase  100 
 
 
496 aa  1001    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000650646  hitchhiker  0.00562163 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4252  leucyl aminopeptidase  61.87 
 
 
495 aa  618  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1516  leucyl aminopeptidase  55.85 
 
 
491 aa  542  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0890319 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2725  leucyl aminopeptidase  55.14 
 
 
492 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00941459  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  47.13 
 
 
497 aa  440  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0295  leucyl aminopeptidase  46.99 
 
 
488 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1016  leucyl aminopeptidase  47.2 
 
 
482 aa  404  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  47.07 
 
 
487 aa  403  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11650  leucyl aminopeptidase  46.2 
 
 
496 aa  394  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3082  leucyl aminopeptidase  43.39 
 
 
498 aa  387  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0737217 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0980  leucyl aminopeptidase  44.47 
 
 
497 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0986  leucyl aminopeptidase  44.7 
 
 
497 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481713  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1124  leucyl aminopeptidase  48.76 
 
 
485 aa  382  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.67356  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1018  leucyl aminopeptidase  44.92 
 
 
497 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0289  leucyl aminopeptidase  42.32 
 
 
501 aa  379  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.823293  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0989  leucyl aminopeptidase  42.86 
 
 
496 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1282  leucyl aminopeptidase  44.83 
 
 
495 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0978  Leucyl aminopeptidase  43.6 
 
 
506 aa  380  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4237  leucyl aminopeptidase  44.59 
 
 
497 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0746  leucyl aminopeptidase  45.59 
 
 
518 aa  378  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.483343  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14470  leucyl aminopeptidase  45.34 
 
 
495 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1271  cytosol aminopeptidase  43.38 
 
 
496 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0628  leucyl aminopeptidase  42.29 
 
 
496 aa  375  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.052928  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2787  leucyl aminopeptidase  44.44 
 
 
499 aa  374  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151843  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1091  leucyl aminopeptidase  43.29 
 
 
496 aa  372  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2099  aminopeptidase A/I  43 
 
 
497 aa  367  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.41187  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0222  leucyl aminopeptidase  42.42 
 
 
496 aa  365  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0191998  normal  0.929203 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3527  leucyl aminopeptidase  43.38 
 
 
512 aa  364  2e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00117428  normal  0.357164 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2140  Leucyl aminopeptidase  42.8 
 
 
496 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727293  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0558  PepA aminopeptidase  42.13 
 
 
497 aa  362  1e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.548083  hitchhiker  0.0000733214 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1748  leucyl aminopeptidase  42.06 
 
 
493 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0580  leucyl aminopeptidase  42.29 
 
 
503 aa  355  1e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458799  normal  0.873186 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2102  leucyl aminopeptidase  39.18 
 
 
512 aa  354  2.9999999999999997e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2083  leucyl aminopeptidase  42.07 
 
 
503 aa  352  5.9999999999999994e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000600102  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1857  Leucyl aminopeptidase  43.04 
 
 
500 aa  352  7e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2201  cytosol aminopeptidase  43.04 
 
 
500 aa  352  7e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.152379  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0296  leucyl aminopeptidase  38.75 
 
 
488 aa  350  5e-95  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00770459 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0961  leucyl aminopeptidase  43.27 
 
 
500 aa  349  6e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0823  leucyl aminopeptidase  41.25 
 
 
503 aa  348  9e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971724  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4047  leucyl aminopeptidase  42.76 
 
 
503 aa  348  1e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00149505  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3679  leucyl aminopeptidase  42.76 
 
 
503 aa  348  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0257256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3543  leucyl aminopeptidase  42.76 
 
 
503 aa  348  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00770626  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03635  leucyl aminopeptidase  41.76 
 
 
502 aa  348  2e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3648  leucyl aminopeptidase  41.91 
 
 
503 aa  348  2e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.433879  normal  0.196646 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2676  leucyl aminopeptidase  42.86 
 
 
511 aa  348  2e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00321125  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1176  leucyl aminopeptidase  41.46 
 
 
503 aa  347  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.624268  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1022  leucyl aminopeptidase  41.67 
 
 
503 aa  347  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1015  leucyl aminopeptidase  41.67 
 
 
503 aa  347  3e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.490931  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0910  leucyl aminopeptidase  40.79 
 
 
502 aa  347  3e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000452493  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0939  leucyl aminopeptidase  40.58 
 
 
502 aa  347  3e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.245826  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0828  leucyl aminopeptidase  41.51 
 
 
503 aa  347  3e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871802  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04126  leucyl aminopeptidase  41.79 
 
 
503 aa  347  4e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0158539  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3737  Leucyl aminopeptidase  41.79 
 
 
503 aa  347  4e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662158  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0740  leucyl aminopeptidase  40.46 
 
 
501 aa  347  4e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04090  hypothetical protein  41.79 
 
 
503 aa  347  4e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0200795  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4516  leucyl aminopeptidase  41.79 
 
 
503 aa  347  4e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000167051  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3752  leucyl aminopeptidase  41.79 
 
 
503 aa  347  4e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00102834  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4740  leucyl aminopeptidase  41.79 
 
 
503 aa  347  4e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000218455  normal  0.712457 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5781  leucyl aminopeptidase  41.79 
 
 
503 aa  347  4e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0325394  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0924  leucyl aminopeptidase  40.17 
 
 
502 aa  346  4e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.317075  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4832  leucyl aminopeptidase  41.79 
 
 
503 aa  347  4e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000259407  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2947  leucyl aminopeptidase  41.67 
 
 
503 aa  346  6e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0672  leucyl aminopeptidase  41.67 
 
 
503 aa  346  6e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131904  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1653  leucyl aminopeptidase  41.67 
 
 
503 aa  346  6e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197906  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2339  leucyl aminopeptidase  41.67 
 
 
503 aa  346  6e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4821  leucyl aminopeptidase  42 
 
 
503 aa  345  8e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000301619  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4826  leucyl aminopeptidase  41.91 
 
 
503 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.956713  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4763  leucyl aminopeptidase  41.91 
 
 
503 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000189037  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4733  leucyl aminopeptidase  41.91 
 
 
503 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.138793  normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4863  leucyl aminopeptidase  41.91 
 
 
503 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0321011  normal  0.585074 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4882  leucyl aminopeptidase  41.91 
 
 
503 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.417344  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0795  leucyl aminopeptidase  39.96 
 
 
502 aa  345  1e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3051  Leucyl aminopeptidase  45.24 
 
 
487 aa  344  2e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00163591  normal  0.235432 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_901  cytosol aminopeptidase/leucyl aminopeptidase  38.63 
 
 
495 aa  344  2e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0210903  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0562  leucyl aminopeptidase  40.96 
 
 
503 aa  344  2e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00163208  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0395  leucyl aminopeptidase  38.54 
 
 
504 aa  345  2e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002428  cytosol aminopeptidase PepA  41.41 
 
 
502 aa  344  2e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00175472  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3262  leucyl aminopeptidase  40.37 
 
 
502 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0507418  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1257  leucyl aminopeptidase  40.37 
 
 
502 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0396745  hitchhiker  0.0000114036 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3119  leucyl aminopeptidase  40.37 
 
 
502 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000969621  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2827  leucyl aminopeptidase  40.17 
 
 
502 aa  343  4e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.246514  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1076  leucyl aminopeptidase  39.75 
 
 
502 aa  343  5.999999999999999e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0190451  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3109  leucyl aminopeptidase  40.17 
 
 
502 aa  342  7e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000897805  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0984  leucyl aminopeptidase  41.04 
 
 
508 aa  342  7e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0871  leucyl aminopeptidase  40.21 
 
 
502 aa  342  8e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0238632  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5797  leucyl aminopeptidase  41.16 
 
 
503 aa  342  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.172158 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1178  leucyl aminopeptidase  40.17 
 
 
502 aa  342  1e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2909  leucyl aminopeptidase  39.75 
 
 
502 aa  341  2e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.112327  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3006  leucyl aminopeptidase  39.75 
 
 
502 aa  341  2e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.132109  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1855  leucyl aminopeptidase  40.96 
 
 
503 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2515  leucyl aminopeptidase  40.75 
 
 
503 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.880203  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2466  leucyl aminopeptidase  40.96 
 
 
503 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1014  leucyl aminopeptidase  39.96 
 
 
502 aa  340  4e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0465604  normal  0.808003 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1368  leucyl aminopeptidase  39.54 
 
 
502 aa  339  5e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2383  leucyl aminopeptidase  40.54 
 
 
503 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0526  leucyl aminopeptidase  38.96 
 
 
502 aa  339  5.9999999999999996e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0735759  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1030  cytosol aminopeptidase family protein  38.38 
 
 
495 aa  339  7e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.414121  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1462  leucyl aminopeptidase  42.24 
 
 
498 aa  339  7e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1372  PepA aminopeptidase  43.75 
 
 
500 aa  338  9.999999999999999e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00219967  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>