23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2480 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2480  putative lipoprotein  100 
 
 		 167 aa  337  4e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.30613e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2373  putative lipoprotein  56.89 
 
 		 167 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.172517  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3286  water stress/hypersensitive response protein  52.69 
 
 		 165 aa  186  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000209158  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3319  Late embryogenesis abundant protein 2  48.78 
 
 		 165 aa  176  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000162689  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0927  Late embryogenesis abundant protein 2  47.56 
 
 		 165 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5672e-31 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1164  water stress/hypersensitive response protein  45.11 
 
 		 168 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0080  hypothetical protein  27.22 
 
 		 295 aa  61.2  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.669106  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0098  Late embryogenesis abundant protein 2  27.22 
 
 		 277 aa  60.8  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.817518  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0086  Late embryogenesis abundant protein 2  27.22 
 
 		 277 aa  60.8  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0149  putative lipoprotein  30.61 
 
 		 160 aa  53.9  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.400959  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2756  water stress/hypersensitive response protein  22.08 
 
 		 264 aa  51.6  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.718779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0384  hypothetical protein  25.58 
 
 		 277 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0079  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  25.9 
 
 		 276 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.801419  normal  0.160349 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2935  late embryogenesis abundant protein 2  24.67 
 
 		 280 aa  49.3  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0413  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  25.38 
 
 		 280 aa  48.5  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0956  water stress/hypersensitive response protein  24.3 
 
 		 144 aa  46.6  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0203  putative lipoprotein  25.81 
 
 		 166 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413636  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0750  hypothetical protein  28.57 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.864897  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3438  Late embryogenesis abundant protein 2  26.26 
 
 		 304 aa  43.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.370192  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0942  putative lipoprotein  24.43 
 
 		 160 aa  42.4  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236049  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01550  putative lipoprotein  24.19 
 
 		 166 aa  42  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814803  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0412  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  24.62 
 
 		 280 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0619  hypothetical protein  21.83 
 
 		 170 aa  40.4  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00260364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>