36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2557 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2557  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  362  1e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.205092  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3232  hypothetical protein  85.21 
 
 
154 aa  256  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.200936 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23960  Activator of Hsp90 ATPase homolog 1-like protein  69.29 
 
 
154 aa  208  3e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.151523  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01460  hypothetical protein  55 
 
 
160 aa  165  4e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29980  hypothetical protein  48.3 
 
 
161 aa  132  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.633203  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0283  hypothetical protein  32.82 
 
 
170 aa  84.3  7e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3939  Polyketide cyclase/dehydrase  35.51 
 
 
149 aa  84  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06190  hypothetical protein  33.1 
 
 
157 aa  82.8  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0758  hypothetical protein  35.92 
 
 
169 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25545  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2275  Polyketide cyclase/dehydrase  31.88 
 
 
151 aa  79.7  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0146  hypothetical protein  33.1 
 
 
167 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2607  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.88 
 
 
161 aa  77.4  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1770  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.99 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2697  hypothetical protein  33.33 
 
 
168 aa  72.8  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408575  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1820  Polyketide cyclase/dehydrase  34.01 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1562  hypothetical protein  30.71 
 
 
164 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0325  hypothetical protein  31.85 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.246806  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1616  hypothetical protein  30.71 
 
 
164 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1592  hypothetical protein  30.71 
 
 
164 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22480  hypothetical protein  29.01 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2610  hypothetical protein  30.94 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10089  hypothetical protein  28.89 
 
 
224 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.29102  normal  0.214951 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2215  hypothetical protein  27.56 
 
 
158 aa  57.4  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.581092  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2272  hypothetical protein  27.56 
 
 
158 aa  57.4  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509187  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2226  hypothetical protein  27.56 
 
 
158 aa  57.4  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424753  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5222  Polyketide cyclase/dehydrase  29.85 
 
 
147 aa  55.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.178812  normal  0.128048 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00890  Activator of Hsp90 ATPase homolog 1-like protein  28.97 
 
 
194 aa  55.5  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2498  hypothetical protein  29.08 
 
 
159 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.515948 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0670  hypothetical protein  30.99 
 
 
154 aa  53.9  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.338735  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3512  hypothetical protein  27.08 
 
 
200 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5552  hypothetical protein  28.87 
 
 
160 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5260  hypothetical protein  28.87 
 
 
160 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.459983  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5171  hypothetical protein  28.87 
 
 
160 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0838  hypothetical protein  30.28 
 
 
162 aa  51.6  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.103566  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21390  hypothetical protein  25.9 
 
 
184 aa  48.9  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3906  hypothetical protein  27.21 
 
 
159 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.869283 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>