More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0115 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0115  30S ribosomal protein S19  100 
 
 
92 aa  192  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  7.09655e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0111  30S ribosomal protein S19  98.91 
 
 
92 aa  190  5e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0108  30S ribosomal protein S19  85.87 
 
 
92 aa  172  2e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  2.57453e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0114  30S ribosomal protein S19  84.78 
 
 
92 aa  171  3e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  1.18397e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0110  30S ribosomal protein S19  84.78 
 
 
92 aa  171  3e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.16547e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0114  30S ribosomal protein S19  84.78 
 
 
92 aa  171  3e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  3.83993e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0126  30S ribosomal protein S19  84.78 
 
 
92 aa  171  3e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.97601e-62 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0108  30S ribosomal protein S19  84.78 
 
 
92 aa  171  3e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  5.59577e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0114  30S ribosomal protein S19  84.78 
 
 
92 aa  171  3e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  7.93752e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0145  30S ribosomal protein S19  84.78 
 
 
92 aa  171  3e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  2.9175e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2707  ribosomal protein S19  83.52 
 
 
93 aa  169  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00775426  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0135  30S ribosomal protein S19  82.61 
 
 
92 aa  166  7e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  7.77644e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0109  30S ribosomal protein S19  82.61 
 
 
92 aa  166  7e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  1.85939e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1827  30S ribosomal protein S19  79.35 
 
 
92 aa  161  3e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476916  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2398  30S ribosomal protein S19  81.52 
 
 
92 aa  160  4e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0423225  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2314  30S ribosomal protein S19  79.35 
 
 
92 aa  160  6e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  2.75126e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2273  30S ribosomal protein S19  79.35 
 
 
92 aa  160  6e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  6.81992e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0062  30S ribosomal protein S19  80.43 
 
 
92 aa  160  6e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.235454  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1903  30S ribosomal protein S19  79.35 
 
 
92 aa  157  5e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1520  30S ribosomal protein S19  77.78 
 
 
94 aa  157  6e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.914288  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0290  ribosomal protein S19  76.67 
 
 
94 aa  156  9e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00533936  normal  0.0406093 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0219  ribosomal protein S19  75.56 
 
 
94 aa  155  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00075195  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2329  ribosomal protein S19  72.83 
 
 
94 aa  155  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  2.39943e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3663  30S ribosomal protein S19  75 
 
 
92 aa  154  6e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  2.30775e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1741  30S ribosomal protein S19  82.14 
 
 
94 aa  153  9e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  7.45132e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0245  30S ribosomal protein S19  76.09 
 
 
92 aa  153  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.948054  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0248  30S ribosomal protein S19  76.09 
 
 
92 aa  153  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1570  ribosomal protein S19  79.76 
 
 
95 aa  152  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000162931  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04020  SSU ribosomal protein S19P  73.91 
 
 
93 aa  150  5e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.904114 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6610  ribosomal protein S19  73.91 
 
 
93 aa  150  6e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2456  30S ribosomal protein S19  75.56 
 
 
94 aa  150  6e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0781906 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3707  30S ribosomal protein S19  73.91 
 
 
92 aa  150  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10719  30S ribosomal protein S19  75 
 
 
93 aa  150  7e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.560637  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0200  30S ribosomal protein S19  76.67 
 
 
92 aa  149  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.130861  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1309  30S ribosomal protein S19  73.91 
 
 
93 aa  148  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.415086  normal  0.102263 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0229  30S ribosomal protein S19  77.38 
 
 
94 aa  148  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5045  30S ribosomal protein S19  73.91 
 
 
93 aa  148  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0166823  normal  0.166411 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3754  ribosomal protein S19  72.83 
 
 
93 aa  148  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.396407  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1034  30S ribosomal protein S19  72.83 
 
 
93 aa  147  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702423  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1044  30S ribosomal protein S19  72.83 
 
 
93 aa  147  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.917027 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1017  30S ribosomal protein S19  72.83 
 
 
93 aa  147  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0599  SSU ribosomal protein S19P  78.02 
 
 
93 aa  146  8e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  6.98901e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2228  30S ribosomal protein S19  75 
 
 
91 aa  146  9e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.749299  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0295  30S ribosomal protein S19  77.78 
 
 
95 aa  146  1e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.07171e-28 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0402  ribosomal protein S19  71.74 
 
 
93 aa  146  1e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4503  ribosomal protein S19  70.65 
 
 
93 aa  145  1e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0762  30S ribosomal protein S19  72.22 
 
 
93 aa  146  1e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  3.24039e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3431  ribosomal protein S19  71.74 
 
 
93 aa  145  2e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1479  30S ribosomal protein S19  74.44 
 
 
92 aa  145  2e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  1.00363e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5128  ribosomal protein S19  69.57 
 
 
92 aa  145  2e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.76287 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1127  ribosomal protein S19  69.57 
 
 
93 aa  145  2e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.831563  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0198  SSU ribosomal protein S19P  76.19 
 
 
94 aa  145  2e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0174859  normal  0.0509464 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0695  30S ribosomal protein S19  72.83 
 
 
92 aa  145  2e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208226  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0310  30S ribosomal protein S19  70.65 
 
 
93 aa  145  2e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187056 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1296  30S ribosomal protein S19  70.33 
 
 
92 aa  144  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00413729  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2563  30S ribosomal protein S19  71.74 
 
 
92 aa  145  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.61073  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4311  30S ribosomal protein S19  71.74 
 
 
93 aa  144  4e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0426  30S ribosomal protein S19  67.78 
 
 
93 aa  144  4e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0022508  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3919  30S ribosomal protein S19  71.74 
 
 
93 aa  144  4e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01210  ribosomal protein S19  72.22 
 
 
94 aa  144  4e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.441353  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0566  30S ribosomal protein S19  70.65 
 
 
92 aa  144  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6045  30S ribosomal protein S19  70.65 
 
 
93 aa  144  6e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.852276  normal  0.340402 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2174  ribosomal protein S19  70.33 
 
 
91 aa  143  8e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.765738  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3991  ribosomal protein S19  72.83 
 
 
91 aa  143  8e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2971  30S ribosomal protein S19  71.74 
 
 
93 aa  143  9e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.241839  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2642  SSU ribosomal protein S19P  69.57 
 
 
92 aa  143  9e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.570508  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20830  30S ribosomal protein S19  70.65 
 
 
92 aa  142  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4317  ribosomal protein S19  70.65 
 
 
93 aa  142  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1711  30S ribosomal protein S19  70.65 
 
 
92 aa  142  1e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.374721  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3008  30S ribosomal protein S19  72.83 
 
 
91 aa  142  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0207995  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0586  30S ribosomal protein S19  70.65 
 
 
93 aa  142  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2683  30S ribosomal protein S19  71.74 
 
 
93 aa  142  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17120  30S ribosomal protein S19  73.91 
 
 
93 aa  142  1e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0814884  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2395  30S ribosomal protein S19  69.57 
 
 
93 aa  142  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2710  30S ribosomal protein S19  69.57 
 
 
93 aa  142  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0985  30S ribosomal protein S19  74.7 
 
 
94 aa  141  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0591  30S ribosomal protein S19  72.83 
 
 
93 aa  141  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.187847  normal  0.796631 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09960  SSU ribosomal protein S19P  76.19 
 
 
86 aa  141  3e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.328032  hitchhiker  1.40006e-06 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2907  30S ribosomal protein S19  70 
 
 
94 aa  141  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.761008  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29700  SSU ribosomal protein S19P  72.83 
 
 
93 aa  141  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.339841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1090  30S ribosomal protein S19  68.48 
 
 
92 aa  140  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0844216 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0719  ribosomal protein S19  67.39 
 
 
94 aa  141  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0631  ribosomal protein S19  72.83 
 
 
93 aa  141  4e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2655  ribosomal protein S19  71.74 
 
 
93 aa  141  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0846  ribosomal protein S19  69.15 
 
 
94 aa  140  8e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1180  ribosomal protein S19  65.93 
 
 
93 aa  140  9e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000119264  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1189  30S ribosomal protein S19  69.57 
 
 
93 aa  139  1e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0653663 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0588  30S ribosomal protein S19  67.39 
 
 
92 aa  138  2e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  9.35387e-09  normal  0.434912 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2903  ribosomal protein S19  67.78 
 
 
94 aa  138  2e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2615  30S ribosomal protein S19  65.22 
 
 
92 aa  139  2e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00302204  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0287  30S ribosomal protein S19  67.39 
 
 
92 aa  138  2e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  1.09471e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3911  30S ribosomal protein S19  67.39 
 
 
92 aa  138  2e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.43627e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0258a  30S ribosomal protein S19  68.48 
 
 
92 aa  139  2e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3139  ribosomal protein S19  70.65 
 
 
93 aa  138  2e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3818  30S ribosomal protein S19  67.39 
 
 
92 aa  138  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  5.35385e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0871  30S ribosomal protein S19  70.33 
 
 
93 aa  138  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  2.15821e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3997  30S ribosomal protein S19  67.39 
 
 
92 aa  138  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  8.77043e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0692  30S ribosomal protein S19  67.39 
 
 
93 aa  138  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.40634 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4272  30S ribosomal protein S19  72.83 
 
 
91 aa  137  4e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  2.53887e-05  unclonable  3.38266e-12 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1157  ribosomal protein S19  73.49 
 
 
86 aa  137  4e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  3.21544e-07  hitchhiker  5.15171e-07 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>