18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0667 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0667  hypothetical protein  100 
 
 
314 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.37864  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3676  hypothetical protein  42.99 
 
 
314 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128628  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2842  hypothetical protein  48.57 
 
 
315 aa  259  4e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139293  hitchhiker  0.000000000000178909 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2762  hypothetical protein  41.37 
 
 
314 aa  238  6.999999999999999e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1478  hypothetical protein  41.03 
 
 
317 aa  231  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00443079 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2609  hypothetical protein  33.65 
 
 
317 aa  159  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.051078  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0760  hypothetical protein  36.82 
 
 
322 aa  155  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000614648  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3186  hypothetical protein  31.17 
 
 
325 aa  105  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.46732  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1997  hypothetical protein  29.65 
 
 
318 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0008  hypothetical protein  29.47 
 
 
327 aa  73.2  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4352  membrane protein-like protein  23.7 
 
 
319 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3304  membrane protein-like protein  25.24 
 
 
319 aa  53.1  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3414  IG hypothetical 15508  22.58 
 
 
308 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00386324  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2444  hypothetical protein  24.16 
 
 
304 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00497862 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23330  predicted membrane protein  26.37 
 
 
295 aa  51.2  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000027962  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0653  membrane protein-like protein  24.59 
 
 
319 aa  51.2  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.547059  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2821  hypothetical protein  24.16 
 
 
193 aa  50.8  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.825231  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2459  hypothetical protein  22.97 
 
 
320 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.190883 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>