More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0078 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0078  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  100 
 
 
345 aa  710  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.76224e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0096  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  98.84 
 
 
345 aa  703  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600015  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0106  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  74.13 
 
 
347 aa  541  1e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  5.17631e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3554  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  74.13 
 
 
347 aa  541  1e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169079 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0111  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  74.42 
 
 
347 aa  542  1e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  2.8675e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0109  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  74.13 
 
 
347 aa  541  1e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  8.1181e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00103  hypothetical protein  74.42 
 
 
347 aa  542  1e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00104  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  74.42 
 
 
347 aa  542  1e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0649  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  72.97 
 
 
347 aa  538  1e-152  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.453768  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0097  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  73.84 
 
 
347 aa  539  1e-152  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  2.47841e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0108  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  73.84 
 
 
347 aa  538  1e-152  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.15881e-05  normal  0.600048 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0161  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  73.55 
 
 
347 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  3.4815e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0158  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  73.55 
 
 
347 aa  534  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.859711  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0155  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  73.55 
 
 
347 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00144171  normal  0.0933514 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0154  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  73.55 
 
 
347 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000490332  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3497  guanosine monophosphate reductase  73.84 
 
 
347 aa  536  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0153  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  73.55 
 
 
347 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.774508  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3408  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  70.93 
 
 
346 aa  521  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.163822  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3765  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  71.51 
 
 
346 aa  516  1e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41308  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3578  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  71.22 
 
 
346 aa  515  1e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0169175  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0663  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  70.93 
 
 
346 aa  517  1e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3373  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  70.43 
 
 
347 aa  513  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1044  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  70.43 
 
 
347 aa  513  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0547285 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3501  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  70.43 
 
 
347 aa  513  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0580253  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4233  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  67.25 
 
 
347 aa  511  1e-144  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.439101  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0775  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  70.72 
 
 
347 aa  510  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.396422 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1080  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  68.12 
 
 
347 aa  505  1e-142  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0624  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  71.51 
 
 
346 aa  503  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0602959  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0501  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  66.67 
 
 
347 aa  498  1e-140  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0639635  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06224  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  67.25 
 
 
347 aa  497  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000471  GMP reductase  66.09 
 
 
347 aa  489  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0604  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  58.17 
 
 
347 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5041  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  57.02 
 
 
347 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0217  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  56.73 
 
 
347 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1029  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  52.19 
 
 
367 aa  371  1e-102  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3045  GMP reductase  37.72 
 
 
374 aa  200  2e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.9 
 
 
508 aa  198  1e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  1.89991e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.8 
 
 
380 aa  194  2e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  5.87091e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3266  GMP reductase  37.2 
 
 
368 aa  194  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.623194  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0041  IMP dehydrogenase/GMP reductase  33.98 
 
 
384 aa  192  9e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1070  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  40.98 
 
 
485 aa  189  4e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.462822  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2902  hypothetical protein  33.24 
 
 
337 aa  186  4e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2755  hypothetical protein  33.24 
 
 
337 aa  186  4e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  43.89 
 
 
488 aa  185  9e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212236  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.84 
 
 
488 aa  184  2e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1200  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  41.02 
 
 
492 aa  184  2e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1137  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  40.62 
 
 
489 aa  184  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1628  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.21 
 
 
497 aa  184  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.13 
 
 
482 aa  183  5e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1064  GMP reductase  36.04 
 
 
349 aa  182  6e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.361476  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0514  response regulator receiver protein  33.53 
 
 
484 aa  182  7e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135977  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  43.84 
 
 
488 aa  182  7e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.83 
 
 
482 aa  182  8e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.67 
 
 
486 aa  182  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  1.2591e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0029  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  41.99 
 
 
485 aa  181  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0916  IMP dehydrogenase  38.7 
 
 
484 aa  181  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.366746  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0999  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  41.89 
 
 
491 aa  180  4e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  4.99041e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1766  IMP dehydrogenase/GMP reductase  35.63 
 
 
369 aa  179  6e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1646  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.02 
 
 
484 aa  179  7e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.536649  hitchhiker  5.11927e-08 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0500  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.52 
 
 
490 aa  179  9e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  45.25 
 
 
487 aa  178  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0749  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  43.44 
 
 
493 aa  178  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1790  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  43.52 
 
 
499 aa  178  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00154566  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1108  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  40.98 
 
 
485 aa  178  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.927877  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1578  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.67 
 
 
483 aa  178  1e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0722651  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0489  IMP dehydrogenase  42.13 
 
 
497 aa  177  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1159  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.19 
 
 
483 aa  177  3e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.839971  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3166  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.55 
 
 
496 aa  177  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.224874  normal  0.708004 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2939  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.55 
 
 
496 aa  177  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.27006 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1049  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.05 
 
 
496 aa  176  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106058 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1433  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  40.62 
 
 
496 aa  176  6e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.51558 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2146  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.07 
 
 
498 aa  176  7e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  44.34 
 
 
487 aa  176  7e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.303266  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1012  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.39 
 
 
498 aa  175  1e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.155508 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.73 
 
 
488 aa  175  1e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3126  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.65 
 
 
486 aa  174  1e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.151477 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1906  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.34 
 
 
484 aa  175  1e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0011  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  40.23 
 
 
487 aa  174  2e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  40.23 
 
 
487 aa  174  2e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241162  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  39.84 
 
 
487 aa  174  3e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5306  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  43.89 
 
 
487 aa  174  3e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1923  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.96 
 
 
496 aa  174  3e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2546  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.75 
 
 
498 aa  173  3e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.509974  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0012  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  43.89 
 
 
487 aa  173  3e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0594668  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0014  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  39.84 
 
 
487 aa  173  4e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0120798  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0011  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.55 
 
 
494 aa  173  4e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  39.84 
 
 
487 aa  173  4e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1616  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.93 
 
 
486 aa  173  4e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  39.84 
 
 
487 aa  173  4e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.34316  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0697  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.59 
 
 
490 aa  173  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0725248  normal  0.819187 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0742  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.6 
 
 
510 aa  173  5e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00516677  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1904  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.46 
 
 
483 aa  172  7e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00977743  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3122  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.75 
 
 
496 aa  172  7e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.98 
 
 
496 aa  172  8e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0069  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  43.3 
 
 
488 aa  172  8e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.110755  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1127  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.59 
 
 
382 aa  172  9e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  2.70815e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0012  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  39.84 
 
 
487 aa  172  9e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0288  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.73 
 
 
486 aa  171  1e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0613  IMP dehydrogenase  38.52 
 
 
486 aa  171  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000830235  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0988  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  40.69 
 
 
485 aa  171  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00325513  hitchhiker  0.000530591 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>