15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5539 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0404  hypothetical protein  75 
 
 		 476 aa  657    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1030  hypothetical protein  92.17 
 
 		 572 aa  967    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5326  replication initiator protein  85.24 
 
 		 572 aa  910    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0860408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5522  replication initiator protein  83.48 
 
 		 569 aa  885    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0195674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5539  replication initiator protein  100 
 
 		 573 aa  1149    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6307  replication initiator protein  93.37 
 
 		 572 aa  1008    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8558  replication initiator protein  58.63 
 
 		 543 aa  593  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0404857  hitchhiker  0.00106122 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0041  hypothetical protein  58.83 
 
 		 552 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5291  hypothetical protein  52.76 
 
 		 568 aa  557  1e-157  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.872454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0150  hypothetical protein  52.29 
 
 		 577 aa  526  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0922  hypothetical protein  52.09 
 
 		 527 aa  522  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0693  hypothetical protein  50.74 
 
 		 550 aa  523  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.270288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6362  hypothetical protein  51.72 
 
 		 555 aa  508  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2945  hypothetical protein  55.36 
 
 		 56 aa  63.5  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1563  replication initiation protein  25.67 
 
 		 449 aa  45.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041515 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>