20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2896 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2896  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  363  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0517  hypothetical protein  34.78 
 
 		 177 aa  92  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0339  hypothetical protein  35.57 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.201274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3201  hypothetical protein  31.17 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7188  hypothetical protein  32.37 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3285  hypothetical protein  29.14 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.605935  normal  0.182498 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4177  hypothetical protein  31.39 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1506  hypothetical protein  30.6 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640405  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5534  hypothetical protein  30.08 
 
 		 139 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.940856 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5242  hypothetical protein  30.08 
 
 		 139 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.766001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5153  hypothetical protein  30.08 
 
 		 139 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2186  hypothetical protein  29.93 
 
 		 163 aa  51.2  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0503259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0302  hypothetical protein  28.99 
 
 		 163 aa  48.1  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.029098  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0361  hypothetical protein  30.92 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.907929 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3789  hypothetical protein  30.22 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.267305  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  25.74 
 
 		 135 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  25.74 
 
 		 135 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  25.74 
 
 		 135 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3322  hypothetical protein  27.27 
 
 		 179 aa  42  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0579422  hitchhiker  0.000746889 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3745  hypothetical protein  27.27 
 
 		 187 aa  40.8  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.875835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>