18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0054 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0054  putative O-methyltransferase  100 
 
 
322 aa  635    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4649  hypothetical protein  53.33 
 
 
330 aa  323  2e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3312  hypothetical protein  41.85 
 
 
750 aa  236  3e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.224991  normal  0.22315 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1125  hypothetical protein  47.31 
 
 
346 aa  236  4e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2031  putative O-methyltransferase  42.7 
 
 
281 aa  182  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.548369 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1823  putative O-methyltransferase  42.37 
 
 
283 aa  161  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.509784  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1841  hypothetical protein  38.7 
 
 
309 aa  156  4e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.447745  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4466  putative O-methyltransferase  38.78 
 
 
260 aa  152  5e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3996  hypothetical protein  41.35 
 
 
265 aa  152  8.999999999999999e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.570232 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1334  hypothetical protein  38.1 
 
 
276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.368124  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0604  putative O-methyltransferase  39.13 
 
 
289 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6753  hypothetical protein  41.2 
 
 
255 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.477413 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3938  protein-L-isoaspartate(D-aspartate)O- methyltransferase  40.08 
 
 
693 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.791097  normal  0.0454105 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0204  putative O-methyltransferase  41.18 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.650886  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5369  hypothetical protein  89.36 
 
 
92 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0066  Lantibiotic dehydratase domain protein  28.74 
 
 
1148 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433774 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0903  Lantibiotic dehydratase domain protein  26.71 
 
 
1036 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0102  hypothetical protein  32.22 
 
 
302 aa  43.9  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102603  normal  0.677611 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>