28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2526 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2526  HhH-GPD  100 
 
 		 223 aa  448  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6604  HhH-GPD family protein  76.96 
 
 		 191 aa  304  6e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4049  HhH-GPD  60.45 
 
 		 193 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0272645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4124  HhH-GPD family protein  60.45 
 
 		 193 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.293882  normal  0.585428 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4278  HhH-GPD family protein  60.45 
 
 		 193 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4556  HhH-GPD family protein  56.76 
 
 		 194 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.363897  normal  0.250068 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7074  HhH-GPD family protein  56.98 
 
 		 193 aa  211  7.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.749596 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11180  hypothetical protein  57.22 
 
 		 195 aa  210  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.838614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2147  HhH-GPD family protein  56.9 
 
 		 194 aa  204  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00539859  normal  0.0545007 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3560  HhH-GPD family protein  56.22 
 
 		 203 aa  202  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0487584  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3780  HhH-GPD family protein  57.23 
 
 		 197 aa  201  7e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0224351  normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1433  HhH-GPD family protein  52.51 
 
 		 204 aa  182  3e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.638307  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1429  HhH-GPD family protein  52.57 
 
 		 193 aa  182  3e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24020  uncharacterized HhH-GPD family protein  52.57 
 
 		 194 aa  180  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.355223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1142  HhH-GPD family protein  52.75 
 
 		 196 aa  178  4.999999999999999e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1417  HhH-GPD family protein  52.98 
 
 		 190 aa  178  5.999999999999999e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.358135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0384  HhH-GPD family protein  48.88 
 
 		 195 aa  176  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3342  HhH-GPD family protein  52.27 
 
 		 195 aa  174  8e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0712  HhH-GPD family protein  47.22 
 
 		 195 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0249  HhH-GPD family protein  48.57 
 
 		 194 aa  171  7.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1408  HhH-GPD family protein  47.22 
 
 		 196 aa  171  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2883  HhH-GPD family protein  50.28 
 
 		 193 aa  165  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2964  HhH-GPD family protein  46.52 
 
 		 188 aa  161  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.921291  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5036  HhH-GPD family protein  51.43 
 
 		 183 aa  134  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0627719  normal  0.0580074 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0488  hypothetical protein  75.61 
 
 		 46 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6629  hypothetical protein  90.32 
 
 		 45 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6611  hypothetical protein  86.67 
 
 		 45 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1010  HhH-GPD family protein  32.48 
 
 		 296 aa  42.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>