24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2883 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2883  HhH-GPD family protein  100 
 
 
193 aa  387  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1429  HhH-GPD family protein  65.17 
 
 
193 aa  235  3e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4049  HhH-GPD  62.71 
 
 
193 aa  234  7e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0272645  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4278  HhH-GPD family protein  62.71 
 
 
193 aa  234  7e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4124  HhH-GPD family protein  62.71 
 
 
193 aa  234  7e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.293882  normal  0.585428 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4556  HhH-GPD family protein  62.23 
 
 
194 aa  229  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.363897  normal  0.250068 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24020  uncharacterized HhH-GPD family protein  60.67 
 
 
194 aa  228  4e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.355223  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1417  HhH-GPD family protein  63.43 
 
 
190 aa  224  4e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.358135  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11180  hypothetical protein  56.91 
 
 
195 aa  221  4e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.838614  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2147  HhH-GPD family protein  60.45 
 
 
194 aa  215  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00539859  normal  0.0545007 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3560  HhH-GPD family protein  57.89 
 
 
203 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0487584  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0384  HhH-GPD family protein  60 
 
 
195 aa  207  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3780  HhH-GPD family protein  58.66 
 
 
197 aa  201  6e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0224351  normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0249  HhH-GPD family protein  57.14 
 
 
194 aa  200  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7074  HhH-GPD family protein  56.18 
 
 
193 aa  199  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.749596 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1142  HhH-GPD family protein  59.67 
 
 
196 aa  196  1.0000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6604  HhH-GPD family protein  50 
 
 
191 aa  194  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2526  HhH-GPD  50.28 
 
 
223 aa  182  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1408  HhH-GPD family protein  53.93 
 
 
196 aa  179  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2964  HhH-GPD family protein  54.44 
 
 
188 aa  174  5e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.921291  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0712  HhH-GPD family protein  48.89 
 
 
195 aa  167  1e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3342  HhH-GPD family protein  52.54 
 
 
195 aa  164  5e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1433  HhH-GPD family protein  50.27 
 
 
204 aa  164  6.9999999999999995e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.638307  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5036  HhH-GPD family protein  38.74 
 
 
183 aa  122  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0627719  normal  0.0580074 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>