25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11180 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11180  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  394  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.838614  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4049  HhH-GPD  77.65 
 
 
193 aa  293  7e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0272645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4124  HhH-GPD family protein  77.65 
 
 
193 aa  293  7e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.293882  normal  0.585428 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4278  HhH-GPD family protein  77.65 
 
 
193 aa  293  7e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4556  HhH-GPD family protein  72.02 
 
 
194 aa  284  5e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.363897  normal  0.250068 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2147  HhH-GPD family protein  73.45 
 
 
194 aa  271  6e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00539859  normal  0.0545007 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1429  HhH-GPD family protein  66.29 
 
 
193 aa  235  4e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0249  HhH-GPD family protein  62.86 
 
 
194 aa  224  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1417  HhH-GPD family protein  61.93 
 
 
190 aa  221  4e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.358135  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24020  uncharacterized HhH-GPD family protein  60.23 
 
 
194 aa  218  5e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.355223  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0384  HhH-GPD family protein  60.57 
 
 
195 aa  217  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6604  HhH-GPD family protein  55.08 
 
 
191 aa  209  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2526  HhH-GPD  57.3 
 
 
223 aa  207  9e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3560  HhH-GPD family protein  55.5 
 
 
203 aa  204  7e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0487584  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1408  HhH-GPD family protein  56.5 
 
 
196 aa  204  7e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7074  HhH-GPD family protein  57.78 
 
 
193 aa  203  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.749596 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3780  HhH-GPD family protein  61.05 
 
 
197 aa  202  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0224351  normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2883  HhH-GPD family protein  57.3 
 
 
193 aa  202  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2964  HhH-GPD family protein  55.85 
 
 
188 aa  200  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.921291  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1142  HhH-GPD family protein  55.74 
 
 
196 aa  195  3e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3342  HhH-GPD family protein  57.63 
 
 
195 aa  187  8e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1433  HhH-GPD family protein  50 
 
 
204 aa  179  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.638307  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0712  HhH-GPD family protein  48.35 
 
 
195 aa  174  6e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5036  HhH-GPD family protein  50 
 
 
183 aa  136  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0627719  normal  0.0580074 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1887  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.92 
 
 
230 aa  41.6  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00394166  normal  0.954448 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>