24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3342 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3342  HhH-GPD family protein  100 
 
 
195 aa  391  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1408  HhH-GPD family protein  70.93 
 
 
196 aa  256  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4556  HhH-GPD family protein  65.61 
 
 
194 aa  247  7e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.363897  normal  0.250068 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2147  HhH-GPD family protein  64.77 
 
 
194 aa  229  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00539859  normal  0.0545007 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4049  HhH-GPD  62.57 
 
 
193 aa  228  4e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0272645  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4278  HhH-GPD family protein  62.57 
 
 
193 aa  228  4e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4124  HhH-GPD family protein  62.57 
 
 
193 aa  228  4e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.293882  normal  0.585428 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2964  HhH-GPD family protein  61.83 
 
 
188 aa  223  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.921291  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1142  HhH-GPD family protein  61.41 
 
 
196 aa  221  4e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1417  HhH-GPD family protein  63.22 
 
 
190 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.358135  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3560  HhH-GPD family protein  58.51 
 
 
203 aa  207  7e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0487584  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11180  hypothetical protein  56.91 
 
 
195 aa  206  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.838614  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0384  HhH-GPD family protein  58.29 
 
 
195 aa  196  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6604  HhH-GPD family protein  51.85 
 
 
191 aa  196  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1429  HhH-GPD family protein  58.05 
 
 
193 aa  195  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0249  HhH-GPD family protein  57.71 
 
 
194 aa  195  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24020  uncharacterized HhH-GPD family protein  57.47 
 
 
194 aa  194  8.000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.355223  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7074  HhH-GPD family protein  55 
 
 
193 aa  192  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.749596 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3780  HhH-GPD family protein  56 
 
 
197 aa  188  4e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0224351  normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2526  HhH-GPD  52.27 
 
 
223 aa  187  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0712  HhH-GPD family protein  46.96 
 
 
195 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1433  HhH-GPD family protein  48.09 
 
 
204 aa  165  4e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.638307  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2883  HhH-GPD family protein  51.96 
 
 
193 aa  164  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5036  HhH-GPD family protein  42.86 
 
 
183 aa  133  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0627719  normal  0.0580074 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>