10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2059 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2059  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  367  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00223204  normal  0.0587281 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2782  hypothetical protein  56.07 
 
 		 224 aa  181  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0184  hypothetical protein  47.47 
 
 		 184 aa  145  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.974158  normal  0.4191 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3488  hypothetical protein  46.82 
 
 		 218 aa  134  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0807596  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6316  hypothetical protein  43.26 
 
 		 193 aa  134  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296729  normal  0.350264 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11060  hypothetical protein  43.2 
 
 		 231 aa  121  6e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0823  hypothetical protein  40.45 
 
 		 204 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3208  hypothetical protein  39.77 
 
 		 197 aa  109  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.519918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5949  hypothetical protein  38.67 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1568  hypothetical protein  40.68 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>