61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2632 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_2632  hydrogenase 4 membrane subunit  100 
 
 		 216 aa  428  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1184  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  98.61 
 
 		 216 aa  424  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2619  hydrogenase 4 membrane subunit  98.61 
 
 		 216 aa  424  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2767  hydrogenase 4 membrane subunit  98.61 
 
 		 216 aa  424  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1191  hydrogenase 4 membrane subunit  98.61 
 
 		 216 aa  424  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02339  hypothetical protein  98.61 
 
 		 216 aa  424  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02377  hydrogenase 4, membrane subunit  98.61 
 
 		 216 aa  424  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3707  hydrogenase 4 membrane subunit  98.15 
 
 		 216 aa  421  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2857  hydrogenase 4 membrane subunit  98.15 
 
 		 216 aa  422  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2711  hydrogenase 4 membrane subunit  63.43 
 
 		 216 aa  267  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1282  hydrogenase 4 membrane subunit  62.96 
 
 		 216 aa  263  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.077695  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4572  hydrogenase 4 membrane subunit  56.22 
 
 		 217 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2189  hydrogenase 4 membrane subunit  46.3 
 
 		 216 aa  197  7.999999999999999e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.523819 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00970  hydrogenase 4 membrane subunit  47.32 
 
 		 217 aa  193  1e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1039  hydrogenase 4 membrane subunit  37.26 
 
 		 220 aa  132  3e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000344071  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1912  hydrogenase 4 membrane subunit  37.25 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.199181  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1864  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  36.92 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.31142  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0129  hydrogenase 4 membrane subunit  33.17 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0545856  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0186  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  35.24 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0319  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  23.29 
 
 		 221 aa  72  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.500767  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0177  hypothetical protein  27.78 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1689  hydrogenase, membrane subunit 2-like protein  26.85 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.674662  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0327  hypothetical protein  26.64 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.704563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0109  hydrogenase 4 membrane component  25.93 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1615  putative hydrogenase, membrane subunit  25.93 
 
 		 219 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1530  putative hydrogenase, membrane subunit  25.93 
 
 		 219 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2462  hydrogenase 4 membrane component (E)  26.36 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1263  hypothetical protein  25.93 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.14188  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1140  hydrogenase subunit  26.67 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3215  hypothetical protein  32.41 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3432  NADH dehydrogenase (quinone)  32.41 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.326498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4286  hypothetical protein  33.04 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00379585  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0168  putative hydrogenase-4 component E  29.94 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.456786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2458  NAD-dependent dehydrogenase subunit  31.1 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.124831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6067  hypothetical protein  24.07 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0736972  hitchhiker  0.000527865 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0741  NAD-dependent dehydrogenase subunit  27.39 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0373  NAD-dependent dehydrogenase subunit  31.68 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0256597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2476  hypothetical protein  29.52 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.815072 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3798  NAD-dependent dehydrogenase subunit  29.01 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173142  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3715  NAD-dependent dehydrogenase subunit  29.01 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0518094  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3190  NAD-dependent dehydrogenase subunit  33.66 
 
 		 213 aa  52  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.211977  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1071  NAD-dependent dehydrogenase subunit  33.66 
 
 		 213 aa  52  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  9.47177e-35 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3290  hydrogenase 4 membrane component  23.85 
 
 		 219 aa  51.6  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.540565  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4669  hydrogenase 4 subunit E  24.31 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.253819  normal  0.171348 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0918  hydrogenase 4 membrane component  27.11 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.911214 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0701  hydrogenase 4 membrane component (E)  26.42 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.202504  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0338  NAD-dependent dehydrogenase subunit  33.33 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0793  hypothetical protein  33.71 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3657  NAD-dependent dehydrogenase subunit  29.33 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0452808  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2620  NAD-dependent dehydrogenase subunit  28.67 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.195312  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3783  NAD-dependent dehydrogenase subunit  34.62 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0555648  normal  0.797729 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2556  NAD-dependent dehydrogenase subunit  25.31 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0890  hydrogenase 4 membrane component (E)-like protein  29.33 
 
 		 214 aa  49.7  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.973916  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2599  NAD-dependent dehydrogenase subunit  30.69 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1305  hydrogenase 4 membrane component (E)  26.21 
 
 		 222 aa  48.5  0.00007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0730  hydrogenase subunit  25.83 
 
 		 224 aa  48.5  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0129986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3853  hypothetical protein  34.41 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.395736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1398  hydrogenase 4 membrane component (E)-like protein  30.36 
 
 		 229 aa  47  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1262  hypothetical protein  34.41 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0296387 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10086  hydrogenase hycP  28.07 
 
 		 220 aa  42.7  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000096186  normal  0.18173 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1792  hydrogenase 4 membrane component (E)  24.73 
 
 		 226 aa  42  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.244901  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>