25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1533 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01635  hypothetical protein  97.61 
 
 		 418 aa  808    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.629129  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01625  hypothetical protein  97.61 
 
 		 418 aa  808    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2377  hypothetical protein  98.09 
 
 		 418 aa  812    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000029957  normal  0.0111859 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1976  conserved hypothetical protein  98.56 
 
 		 418 aa  814    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000418237  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1744  hypothetical protein  99.04 
 
 		 418 aa  820    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153793  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1862  hypothetical protein  98.56 
 
 		 418 aa  814    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000261063  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1533  hypothetical protein  100 
 
 		 418 aa  825    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000116235  hitchhiker  0.00188577 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1878  hypothetical protein  98.56 
 
 		 418 aa  814    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000220122  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1965  hypothetical protein  99.04 
 
 		 418 aa  820    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.646442  hitchhiker  0.00000264601 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02119  predicted autotransporter outer membrane protein  29 
 
 		 836 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463949  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02078  hypothetical protein  29 
 
 		 836 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.513967  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2329  putative autotransporter, IS5K-containing  29.14 
 
 		 863 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1468  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29 
 
 		 836 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0686504  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3329  putative autotransporter, IS5K-containing  28.9 
 
 		 863 aa  105  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1458  outer membrane autotransporter  28.21 
 
 		 863 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.925993 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1052  outer membrane autotransporter  28.61 
 
 		 1526 aa  97.1  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1028  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.61 
 
 		 1526 aa  97.1  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3895  hypothetical protein  28.34 
 
 		 1571 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1657  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.18 
 
 		 1039 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.656845  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3347  antigen 43  35.18 
 
 		 948 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2249  antigen 43  37.89 
 
 		 948 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2139  antigen 43, truncation  35.57 
 
 		 583 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4892  antigen 43  35.18 
 
 		 948 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2773  hypothetical protein  28.54 
 
 		 1565 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.426931 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1395  pertactin family protein  38.42 
 
 		 949 aa  86.7  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.830364  normal  0.238303 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>