97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0046 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00048  predicted 4Fe-4S ferredoxin-type protein  100 
 
 
95 aa  199  1e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00047  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  199  1e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0050  ferredoxin homolog FixX  100 
 
 
95 aa  199  1e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3611  putative ferredoxin  100 
 
 
95 aa  199  1e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0167576 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3555  putative ferredoxin  100 
 
 
95 aa  199  1e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0048  ferredoxin homolog FixX  100 
 
 
95 aa  199  1e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0046  ferredoxin homolog FixX  100 
 
 
95 aa  199  1e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.922786 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0048  ferredoxin homolog FixX  98.95 
 
 
95 aa  197  5e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0085  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain-containing protein  88.42 
 
 
95 aa  183  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.807465  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0087  ferredoxin-like protein ydiT  88.42 
 
 
95 aa  183  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0084  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain-containing protein  88.42 
 
 
95 aa  183  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.588767  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0084  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  88.42 
 
 
95 aa  183  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.951067 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0088  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  88.42 
 
 
95 aa  183  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.38578 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4042  putative ferredoxin  67.37 
 
 
95 aa  139  1e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3233  putative ferredoxin  66.32 
 
 
95 aa  139  2e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2680  putative ferredoxin  67.37 
 
 
95 aa  138  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.606102 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1821  putative ferredoxin  68.13 
 
 
97 aa  135  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1481  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain-containing protein  68.13 
 
 
97 aa  135  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0731484 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1903  iron-sulfur cluster-binding protein  62.77 
 
 
97 aa  135  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1447  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  68.13 
 
 
97 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.128489 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1495  iron-sulfur cluster-binding protein  62.77 
 
 
97 aa  135  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.306818 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01669  predicted 4Fe-4S ferredoxin-type protein  62.77 
 
 
97 aa  135  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1917  iron-sulfur cluster-binding protein  62.77 
 
 
97 aa  135  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2417  iron-sulfur cluster-binding protein  62.77 
 
 
97 aa  135  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01658  hypothetical protein  62.77 
 
 
97 aa  135  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1993  ferredoxin like protein  67.03 
 
 
97 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0887759  normal  0.0253227 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1942  iron-sulfur cluster-binding protein  61.7 
 
 
97 aa  133  8e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.332806  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1463  ferredoxin like protein  67.03 
 
 
97 aa  133  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1931  hypothetical protein  62.77 
 
 
97 aa  132  2e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0527008 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1398  ferredoxin-like protein  63.44 
 
 
97 aa  131  4e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0672004  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1028  putative ferredoxin  63.83 
 
 
95 aa  125  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1844  putative ferredoxin  61.54 
 
 
98 aa  122  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.148081  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0314  putative ferredoxin  58.33 
 
 
98 aa  119  2e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0575  hypothetical protein  57.61 
 
 
94 aa  110  8e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1821  putative ferredoxin  53.85 
 
 
99 aa  104  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.09414  normal  0.305366 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3107  putative ferredoxin  53.85 
 
 
99 aa  104  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  3.94196e-05 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09260  ferredoxin-like protein  50.55 
 
 
98 aa  102  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.759582 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08760  ferredoxin-like protein  49.47 
 
 
102 aa  100  6e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.696801 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27810  ferredoxin-like protein  53.68 
 
 
103 aa  98.2  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3926  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  51.06 
 
 
95 aa  87.8  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.540804 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2907  putative ferredoxin  49.32 
 
 
86 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0921  conserved hypothetical protein  48 
 
 
86 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.801629  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3069  putative ferredoxin  49.32 
 
 
86 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02612  predicted 4Fe-4S cluster-containing protein  48 
 
 
86 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02575  hypothetical protein  48 
 
 
86 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0945  hypothetical protein  48 
 
 
86 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.334824 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4022  putative ferredoxin  47.95 
 
 
86 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.878654 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3106  putative ferredoxin  47.95 
 
 
86 aa  85.5  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0911919  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2896  putative ferredoxin  45.33 
 
 
86 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1433  putative ferredoxin like protein; FixX  44.9 
 
 
99 aa  82  2e-15  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102242  normal  0.0121231 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5869  putative ferredoxin protein, FixX  43.48 
 
 
98 aa  81.6  3e-15  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4603  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  47.13 
 
 
93 aa  81.6  3e-15  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1552  ferredoxin-like protein  39.56 
 
 
94 aa  79.7  1e-14  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281745  normal  0.225513 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1091  ferredoxin like protein, fixX  42.55 
 
 
98 aa  79.7  1e-14  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.992271  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1371  putative ferredoxin like protein; FixX  38.78 
 
 
98 aa  78.6  3e-14  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0139  putative ferredoxin protein, FixX  42.55 
 
 
99 aa  78.6  3e-14  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0987  ferredoxin like protein, fixX  40.62 
 
 
98 aa  78.2  4e-14  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0910173 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3613  putative ferredoxin protein, FixX  42.86 
 
 
97 aa  77.8  5e-14  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.122758 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5083  putative ferredoxin protein, FixX  42.55 
 
 
98 aa  77  8e-14  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0490  putative ferredoxin protein, FixX  42.39 
 
 
100 aa  77  8e-14  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2123  hypothetical protein  41.67 
 
 
94 aa  77  9e-14  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2316  putative ferredoxin like protein; FixX  44.21 
 
 
99 aa  76.6  1e-13  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00117269  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4445  ferredoxin like protein, fixX  43.48 
 
 
98 aa  76.3  1e-13  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10550  FixX ferredoxin-like protein  41.3 
 
 
94 aa  75.9  2e-13  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0834352  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2264  ferredoxin  37.5 
 
 
96 aa  75.5  3e-13  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0290114  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7736  putative ferredoxin like protein; FixX  39.18 
 
 
99 aa  74.7  3e-13  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4012  ferredoxin-like protein  40.66 
 
 
94 aa  74.3  5e-13  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3574  ferredoxin-like protein  41.76 
 
 
94 aa  74.3  6e-13  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.183526  normal  0.204612 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6231  FixX ferredoxin-like protein  38.89 
 
 
98 aa  73.2  1e-12  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1196  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.3 
 
 
92 aa  72  2e-12  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1259  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.3 
 
 
92 aa  71.6  3e-12  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0478  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.63 
 
 
98 aa  70.1  9e-12  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  4.49419e-06  decreased coverage  0.000160818 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1477  ferredoxin-like protein  36.17 
 
 
95 aa  68.2  4e-11  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1193  putative ferredoxin like protein; FixX  36.17 
 
 
95 aa  68.2  4e-11  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.170567 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4926  FixX ferredoxin-like protein  41.11 
 
 
98 aa  66.2  1e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3555  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.17 
 
 
92 aa  61.2  4e-09  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1541  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.5 
 
 
106 aa  59.7  1e-08  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0959  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.48 
 
 
110 aa  58.2  4e-08  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3599  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.41 
 
 
111 aa  57  8e-08  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.362888  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1938  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.16 
 
 
106 aa  56.2  1e-07  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1999  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.07 
 
 
96 aa  55.8  2e-07  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0647  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.97 
 
 
96 aa  55.5  2e-07  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.512756  hitchhiker  0.00122416 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0484  monooxygenase FAD-binding protein  34.91 
 
 
561 aa  55.1  3e-07  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.35565  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2370  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.97 
 
 
96 aa  55.1  3e-07  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2134  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.78 
 
 
96 aa  55.1  4e-07  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0061  ferredoxin  34.04 
 
 
92 aa  55.1  4e-07  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664863 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2773  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.48 
 
 
92 aa  54.3  6e-07  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200948  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0334  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.08 
 
 
87 aa  52  2e-06  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4275  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.2 
 
 
90 aa  52.4  2e-06  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0589  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.16 
 
 
89 aa  48.9  2e-05  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000249296  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1250  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.63 
 
 
95 aa  48.9  2e-05  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0637  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.59 
 
 
95 aa  47.8  5e-05  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2197  iron-sulfur cluster-binding protein FixX  36.36 
 
 
105 aa  46.6  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0128  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.1 
 
 
97 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1435  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.03 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.610605  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2615  FAD dependent oxidoreductase  29.25 
 
 
553 aa  41.6  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.489125  normal  0.819562 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4226  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.84 
 
 
206 aa  40.8  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>