25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1976 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01635  hypothetical protein  98.56 
 
 
418 aa  813  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.629129  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1965  hypothetical protein  99.52 
 
 
418 aa  819  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.646442  hitchhiker  2.64601e-06 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1878  hypothetical protein  99.04 
 
 
418 aa  816  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.20122e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1533  hypothetical protein  98.56 
 
 
418 aa  814  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000116235  hitchhiker  0.00188577 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1744  hypothetical protein  99.52 
 
 
418 aa  819  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.53793e-08  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1976  conserved hypothetical protein  100 
 
 
418 aa  825  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  4.18237e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1862  hypothetical protein  99.04 
 
 
418 aa  816  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  2.61063e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2377  hypothetical protein  97.13 
 
 
418 aa  804  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  2.9957e-05  normal  0.0111859 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01625  hypothetical protein  98.56 
 
 
418 aa  813  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3329  putative autotransporter, IS5K-containing  28.44 
 
 
863 aa  103  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560533  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2329  putative autotransporter, IS5K-containing  28.67 
 
 
863 aa  103  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02078  hypothetical protein  28.54 
 
 
836 aa  103  8e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.513967  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02119  predicted autotransporter outer membrane protein  28.54 
 
 
836 aa  103  8e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463949  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1468  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.54 
 
 
836 aa  103  8e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0686504  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1657  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.97 
 
 
1039 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.656845  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1458  outer membrane autotransporter  27.97 
 
 
863 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.925993 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1028  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.34 
 
 
1526 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1052  outer membrane autotransporter  28.34 
 
 
1526 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2249  antigen 43  38.42 
 
 
948 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2139  antigen 43, truncation  40 
 
 
583 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3347  antigen 43  39.47 
 
 
948 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4892  antigen 43  39.47 
 
 
948 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3895  hypothetical protein  27.54 
 
 
1571 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1395  pertactin family protein  38.95 
 
 
949 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.830364  normal  0.238303 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2773  hypothetical protein  28.29 
 
 
1565 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.426931 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>