19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2030 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2030  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 239 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0201  hypothetical protein  51.13 
 
 		 228 aa  191  1e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0020  hypothetical protein  45.02 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0126  MerR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0106  regulatory protein MerR  38.55 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2536  hypothetical protein  41.67 
 
 		 314 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1416  MerR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 130 aa  49.3  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0849625  normal  0.242004 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0043  hypothetical protein  44.44 
 
 		 526 aa  47  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0650  transcriptional regulator, MerR family  30.69 
 
 		 172 aa  43.9  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00809015 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1148  MerR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 169 aa  43.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4629  MerR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 187 aa  43.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00782953  normal  0.030329 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7115  regulatory protein MerR  36.56 
 
 		 116 aa  42.7  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745256  hitchhiker  0.00114042 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2652  MerR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 227 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00282985  normal  0.0609514 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4387  MerR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 757 aa  42.4  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2678  MerR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 252 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00961924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0831  MerR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 177 aa  42  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.087298  normal  0.0939438 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3295  transcriptional regulator, MerR family  28.41 
 
 		 231 aa  42  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987974  normal  0.206317 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7073  transcriptional regulator, MerR family  31.08 
 
 		 172 aa  42  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.323694  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1588  MerR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 195 aa  42  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>