16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0106 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0106  regulatory protein MerR  100 
 
 		 231 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0126  MerR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 291 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0201  hypothetical protein  34 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2030  MerR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0020  hypothetical protein  33.33 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0043  hypothetical protein  48.57 
 
 		 526 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2536  hypothetical protein  40.58 
 
 		 314 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3779  MerR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 367 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2951  hypothetical protein  24.58 
 
 		 400 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2134  MerR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 402 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1416  MerR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 130 aa  45.4  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0849625  normal  0.242004 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2678  MerR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 252 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00961924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3966  MerR family transcriptional regulator  36 
 
 		 167 aa  42.7  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.200799  normal  0.0248998 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3022  transcriptional regulator, MerR family  31.48 
 
 		 250 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.165787  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0650  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 172 aa  42  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00809015 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2925  MerR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 155 aa  41.6  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00455933  hitchhiker  0.00151967 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>