52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2157 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2157  addiction module toxin, RelE/StbE family  100 
 
 
93 aa  189  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  5.41282e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4296  addiction module antitoxin  97.85 
 
 
93 aa  186  7e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  2.63758e-08  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6454  plasmid stabilization system protein  97.85 
 
 
93 aa  186  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0121069  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1164  addiction module antitoxin  81.72 
 
 
93 aa  160  7e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3781  hypothetical protein  73.12 
 
 
93 aa  147  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.881956  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5117  addiction module antitoxin  72.53 
 
 
93 aa  144  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.313763  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3909  addiction module antitoxin  70.97 
 
 
93 aa  140  7e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.342792  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36930  addiction module toxin, RelE/StbE family  68.82 
 
 
93 aa  136  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4381  addiction module toxin, RelE/StbE family  67.74 
 
 
93 aa  132  1e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.554909  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3345  addiction module antitoxin  61 
 
 
100 aa  118  2e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0110991  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2504  addiction module toxin, RelE/StbE family  53.76 
 
 
93 aa  102  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4250  addiction module antitoxin  71.01 
 
 
101 aa  100  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0906167 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2146  addiction module toxin, RelE/StbE family  71.01 
 
 
82 aa  100  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17080  plasmid stabilization system protein/addiction module toxin  55.29 
 
 
92 aa  100  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2035  hypothetical protein  47.31 
 
 
93 aa  86.7  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0547  putative plasmid stabilisation system protein  42.86 
 
 
89 aa  80.9  6e-15  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151138  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0970  hypothetical protein  46.15 
 
 
104 aa  79.3  1e-14  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  4.01968e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0505  hypothetical protein  44.44 
 
 
93 aa  73.2  1e-12  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3186  addiction module toxin, RelE/StbE family  42.39 
 
 
99 aa  72.8  2e-12  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1103  hypothetical protein  35.79 
 
 
99 aa  70.5  7e-12  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0831  PZ12b  40.66 
 
 
88 aa  68.6  3e-11  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.262689  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1713  addiction module toxin, RelE/StbE family  41.11 
 
 
91 aa  68.6  3e-11  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11410  addiction module toxin, RelE/StbE family  46.07 
 
 
93 aa  68.6  3e-11  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1196  addiction module toxin, RelE/StbE family  39.56 
 
 
102 aa  67.8  4e-11  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0001  addiction module antitoxin  48.33 
 
 
89 aa  65.5  2e-10  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  1.55913e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1376  addiction module toxin, RelE/StbE  39.56 
 
 
90 aa  65.5  2e-10  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.13187  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4998  addiction module antitoxin  42.86 
 
 
90 aa  65.9  2e-10  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0479  addiction module antitoxin  39.53 
 
 
90 aa  63.9  7e-10  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.233146  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3395  addiction module antitoxin  40.22 
 
 
92 aa  62  2e-09  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0943  addiction module antitoxin  39.56 
 
 
91 aa  62.4  2e-09  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  1.5998e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0815  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.26 
 
 
101 aa  62  2e-09  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0253  hypothetical protein  40.22 
 
 
92 aa  62  3e-09  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3382  addiction module toxin, RelE/StbE family  39.13 
 
 
92 aa  60.8  7e-09  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3574  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.87 
 
 
90 aa  60.5  8e-09  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00224  hypothetical protein  39.13 
 
 
92 aa  59.7  1e-08  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3768  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.67 
 
 
106 aa  60.1  1e-08  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0258  hypothetical protein  39.13 
 
 
92 aa  59.7  1e-08  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00220  predicted toxin of the YafQ-DinJ toxin-antitoxin system  39.13 
 
 
92 aa  59.7  1e-08  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3886  hypothetical protein  38.04 
 
 
91 aa  58.9  2e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0223  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.87 
 
 
92 aa  58.2  4e-08  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.50496  normal  0.992926 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0303  hypothetical protein  32.26 
 
 
93 aa  57  9e-08  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.217401  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1860  addiction module antitoxin  36.26 
 
 
91 aa  56.2  1e-07  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.998901  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1495  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.52 
 
 
98 aa  56.6  1e-07  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1750  hypothetical protein  35.71 
 
 
106 aa  55.8  2e-07  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00200719  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2862  addiction module antitoxin  41.94 
 
 
79 aa  53.9  7e-07  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806196  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1075  hypothetical protein  38.04 
 
 
90 aa  53.5  9e-07  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4838  addiction module antitoxin  36.63 
 
 
111 aa  53.1  1e-06  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3824  hypothetical protein  35.87 
 
 
91 aa  53.1  1e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.617883  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0841  addiction module toxin, RelE/StbE family  53.49 
 
 
106 aa  50.4  7e-06  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.37027  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0997  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.23 
 
 
107 aa  48.5  3e-05  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4250  hypothetical protein  37.78 
 
 
55 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1311  plasmid stabilization system protein  30.85 
 
 
93 aa  41.2  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.648885  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>