58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0031 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0031  hypothetical protein  100 
 
 
100 aa  206  7e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0013  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  199  9e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0028  hypothetical protein  77.65 
 
 
111 aa  131  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1103  hypothetical protein  82.67 
 
 
85 aa  131  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3825  hypothetical protein  77.63 
 
 
97 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3851  hypothetical protein  70.59 
 
 
89 aa  127  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2398  hypothetical protein  63.54 
 
 
93 aa  124  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.75412  normal  0.60686 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3269  hypothetical protein  65.48 
 
 
92 aa  123  7e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0030  hypothetical protein  73.33 
 
 
82 aa  122  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00696955  normal  0.128102 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0788  hypothetical protein  65.48 
 
 
81 aa  120  6e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0849  hypothetical protein  65.48 
 
 
82 aa  120  6e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4168  hypothetical protein  73.97 
 
 
88 aa  120  7e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3944  hypothetical protein  68 
 
 
82 aa  120  7e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3794  hypothetical protein  65.48 
 
 
81 aa  120  8e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3655  hypothetical protein  64.29 
 
 
82 aa  120  8e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3671  hypothetical protein  65.48 
 
 
81 aa  120  8e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3203  hypothetical protein  65.48 
 
 
81 aa  120  8e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0638  hypothetical protein  65.48 
 
 
81 aa  120  8e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3604  hypothetical protein  65.48 
 
 
81 aa  120  8e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3119  hypothetical protein  63.1 
 
 
82 aa  117  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.83023  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3325  hypothetical protein  65.48 
 
 
81 aa  116  9e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.880589 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3493  hypothetical protein  65.48 
 
 
81 aa  116  9e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3043  hypothetical protein  61.9 
 
 
82 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2512  hypothetical protein  60.71 
 
 
82 aa  115  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0595959  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2044  hypothetical protein  69.74 
 
 
82 aa  114  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.285796  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0628  hypothetical protein  64.29 
 
 
81 aa  114  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2437  hypothetical protein  63.29 
 
 
82 aa  110  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0564  hypothetical protein, putative phage gene  65.33 
 
 
82 aa  110  8.000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.430301  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0485  hypothetical protein  58.33 
 
 
82 aa  107  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.84209 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1352  hypothetical protein  73.75 
 
 
82 aa  104  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56146  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0206  hypothetical protein  60.81 
 
 
105 aa  99.8  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.103093  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04775  glutathione peroxidase  54.65 
 
 
111 aa  99.4  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001051  hypothetical protein  56.1 
 
 
81 aa  97.4  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.160342  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2298  hypothetical protein  59.46 
 
 
89 aa  94.7  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.943989  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0785  hypothetical protein  52.56 
 
 
83 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.239654 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6294  hypothetical protein  48.19 
 
 
82 aa  92.8  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0825  hypothetical protein  52.56 
 
 
83 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.267038  normal  0.202136 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1859  hypothetical protein  51.35 
 
 
78 aa  91.3  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2813  hypothetical protein  53.85 
 
 
89 aa  90.5  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0930467 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2638  hypothetical protein  56 
 
 
95 aa  90.5  7e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3195  glutathione peroxidase  51.28 
 
 
84 aa  90.1  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.672232 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3266  hypothetical protein  52 
 
 
87 aa  90.1  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0853  hypothetical protein  58.11 
 
 
99 aa  89.7  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.193225  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0748  hypothetical protein  53.33 
 
 
81 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.262921  normal  0.873704 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0500  hypothetical protein  50 
 
 
83 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0188771  normal  0.890091 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03057  hypothetical protein  54.79 
 
 
88 aa  87  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5140  hypothetical protein  51.35 
 
 
88 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4514  hypothetical protein  51.35 
 
 
90 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.775414 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0434  hypothetical protein  53.16 
 
 
82 aa  85.1  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.376375 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4147  hypothetical protein  45.35 
 
 
84 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.439074  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3664  hypothetical protein  47.62 
 
 
86 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1898  hypothetical protein  43.02 
 
 
89 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3469  hypothetical protein  45.88 
 
 
89 aa  80.1  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.521818  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2601  hypothetical protein  44.59 
 
 
85 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2630  hypothetical protein  44.59 
 
 
85 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453741  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2645  hypothetical protein  44.59 
 
 
85 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.076199  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1952  hypothetical protein  43.24 
 
 
85 aa  74.3  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4404  hypothetical protein  40.54 
 
 
85 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.721221  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>