63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1278 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1278  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  100 
 
 		 228 aa  457  9.999999999999999e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000199132  normal  0.43012 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2390  dissimilatory sulfite reductase (desulfoviridin) alpha and beta subunits-like  38.22 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000111443  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1914  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  38.24 
 
 		 228 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0781471  normal  0.276703 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0748  proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  35.2 
 
 		 263 aa  125  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1379  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  39.04 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.860949  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0885  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  34.18 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0213138 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0697  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.79 
 
 		 196 aa  95.9  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2218  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S subunit  27.27 
 
 		 289 aa  90.5  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1551  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  33.06 
 
 		 289 aa  89  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2763  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  45.71 
 
 		 198 aa  86.7  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3941  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  26.42 
 
 		 315 aa  86.3  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000105876  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1475  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  27.31 
 
 		 301 aa  85.5  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0347931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2618  sulfite reductase, beta subunit  32.35 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.433957 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1351  iron-sulfur cluster-binding protein  31.01 
 
 		 322 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0619  nitrite and sulphite reductase  28.5 
 
 		 639 aa  80.9  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00799056  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1570  Iron-sulfur cluster-binding protein  29.75 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0018133  normal  0.554511 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2242  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  27.67 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1978  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  27.67 
 
 		 314 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.996407  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0206  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  30.08 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.725882 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0247  hypothetical protein  30.37 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.236948 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1973  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  27.48 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.560438 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0870  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  30.77 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1188  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  26.97 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445325  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1781  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  25.82 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2423  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  33.09 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.755414  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1139  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  25.14 
 
 		 288 aa  68.6  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.079984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0732  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  34.34 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.344007  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1691  anaerobic sulfite reductase, subunit C  30.37 
 
 		 326 aa  67  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0354563  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1425  anaerobic sulfite reductase, subunit C  30.37 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.199179  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1969  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.57 
 
 		 299 aa  67  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000637611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1876  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  25.52 
 
 		 293 aa  67  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2541  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  25.7 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000365571  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1562  sulfite reductase, beta subunit  28.41 
 
 		 319 aa  65.5  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0778  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  26.62 
 
 		 618 aa  64.3  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.542223  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4107  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  25.84 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.975487  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1603  sulfite reductase, subunit C  28.19 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1825  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  23.86 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1168  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  25.38 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00249386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1787  anaerobic sulfite reductase, C subunit  29.33 
 
 		 348 aa  52.8  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2750  sulfite reductase subunit C  25.53 
 
 		 337 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2925  sulfite reductase, subunit C  25.53 
 
 		 337 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2705  sulfite reductase, subunit C  25.53 
 
 		 337 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400771  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2812  sulfite reductase subunit C  25.53 
 
 		 337 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2791  sulfite reductase subunit C  25.53 
 
 		 337 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0557  sulfite reductase, subunit C  25.17 
 
 		 322 aa  51.2  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1127  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.36 
 
 		 282 aa  48.9  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000190957  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0287  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  30.37 
 
 		 337 aa  48.9  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0577  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34 
 
 		 291 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.016855  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0195  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.83 
 
 		 288 aa  46.2  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02274  ferredoxin  29.2 
 
 		 553 aa  46.2  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2163  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.48 
 
 		 283 aa  46.2  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003497  iron-sulfur cluster-binding protein  29.2 
 
 		 553 aa  45.8  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0020  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.4 
 
 		 128 aa  45.4  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1865  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.98 
 
 		 306 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.748281  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3099  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.67 
 
 		 369 aa  44.7  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0141541  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1140  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.91 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.439364  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1446  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  28.85 
 
 		 414 aa  43.9  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1428  hypothetical protein  28.92 
 
 		 379 aa  43.1  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1124  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  47.06 
 
 		 57 aa  43.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.794697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0916  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  33.33 
 
 		 306 aa  43.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0858803  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2418  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.14 
 
 		 652 aa  42  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2897  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.51 
 
 		 384 aa  41.6  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1742  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.78 
 
 		 135 aa  41.6  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0269745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>