24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0583 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0583  flagellar biosynthesis protein FliO  100 
 
 		 129 aa  263  5e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1167  flagellar biogenesis protein FliO  35.48 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3445  flagellar biosynthesis protein, FliO  36.46 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.934306 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1375  flagellar biosynthesis protein, FliO  31.07 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.679292  normal  0.145211 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1971  flagellar protein FliO  33.67 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0391464  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3057  flagellar biosynthesis protein, FliO  31.25 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190988  normal  0.139869 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1335  flagellar biosynthesis protein, FliO  30.4 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3882  flagellar protein FliO  40.85 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3098  hypothetical protein  33.33 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45780  flagellar protein FliO  40 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1191  flagellar biosynthesis protein, FliO  30.21 
 
 		 136 aa  48.1  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1627  flagellar biosynthesis protein FliO  25.25 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3435  flagellar biosynthesis protein FliO  31.73 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3918  flagellar biosynthesis protein FliO  39.73 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1370  flagellar biosynthesis protein FliO  34.38 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4200  hypothetical protein  29.03 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0709  flagellar biosynthetic protein FliO  28.97 
 
 		 211 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.942573  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4756  flagellar biosynthesis protein FliO  27.66 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45659  normal  0.854749 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3679  flagellar biosynthesis protein FliO  27.66 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3909  putative flagellar biogenesis protein  26.67 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00889452 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1985  flagellar biosynthesis protein, FliO  29.36 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.271247  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0376  flagellar FLIO transmembrane protein  32 
 
 		 130 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002824  flagellar biosynthesis protein FliO  23.02 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2940  flagellar biosynthesis protein FliO  30.34 
 
 		 208 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>