20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3909 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3909  putative flagellar biogenesis protein  100 
 
 
159 aa  309  1e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00889452 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3825  putative flagellar biogenesis protein  89.94 
 
 
159 aa  253  9e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4200  hypothetical protein  54.14 
 
 
162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3098  hypothetical protein  56.25 
 
 
158 aa  128  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3291  hypothetical protein  46.4 
 
 
144 aa  106  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3439  hypothetical protein  48.42 
 
 
141 aa  94  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1167  flagellar biogenesis protein FliO  40.38 
 
 
129 aa  57.8  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1335  flagellar biosynthesis protein, FliO  32.14 
 
 
133 aa  52.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1191  flagellar biosynthesis protein, FliO  32.63 
 
 
136 aa  49.7  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3918  flagellar biosynthesis protein FliO  39.71 
 
 
144 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002824  flagellar biosynthesis protein FliO  33.86 
 
 
137 aa  46.2  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5300  flagellar biosynthesis protein, FliO  35.9 
 
 
186 aa  44.7  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.592303  normal  0.104724 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2397  hypothetical protein  44.9 
 
 
140 aa  44.3  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0480  hypothetical protein  30.26 
 
 
165 aa  44.3  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000265  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03152  hypothetical protein  35.06 
 
 
137 aa  43.9  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1375  flagellar biosynthesis protein, FliO  33.72 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.679292  normal  0.145211 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2909  flagellar biosynthesis protein FliO  32.53 
 
 
120 aa  43.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1882  flagellar biosynthetic protein FliO  33.7 
 
 
140 aa  42.4  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3445  flagellar biosynthesis protein, FliO  38.24 
 
 
146 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.934306 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1971  flagellar protein FliO  36.36 
 
 
146 aa  42  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0391464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>