15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0826 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0826  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  393  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0811  hypothetical protein  31.06 
 
 
213 aa  58.9  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.21317  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2178  hypothetical protein  30.34 
 
 
209 aa  58.9  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0251781  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1611  hypothetical protein  31.01 
 
 
213 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0597  hypothetical protein  22.6 
 
 
206 aa  54.3  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4192  hypothetical protein  31.93 
 
 
212 aa  54.3  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0719579  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1367  hypothetical protein  31.25 
 
 
217 aa  51.2  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1225  hypothetical protein  28.34 
 
 
216 aa  50.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4909  transcriptional regulator protein-like protein  27.27 
 
 
276 aa  49.3  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0848  hypothetical protein  31.71 
 
 
213 aa  48.9  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.612361  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4998  transcriptional regulator-like protein  24.03 
 
 
276 aa  48.5  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3119  hypothetical protein  27.92 
 
 
276 aa  46.2  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0792  hypothetical protein  31.93 
 
 
217 aa  45.1  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0960  hypothetical protein  34.83 
 
 
215 aa  43.9  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00158317  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0815  ORF H1617  23.45 
 
 
270 aa  43.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>