33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0127 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0127  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  185  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00495666  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2980  hypothetical protein  71.05 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4103  hypothetical protein  67.65 
 
 		 78 aa  104  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.918286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1434  hypothetical protein  61.84 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3623  hypothetical protein  64.79 
 
 		 96 aa  100  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1139  hypothetical protein  53.01 
 
 		 102 aa  99.8  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1231  hypothetical protein  63.89 
 
 		 90 aa  96.7  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2869  hypothetical protein  58.21 
 
 		 104 aa  94  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2432  hypothetical protein  54.05 
 
 		 101 aa  90.5  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1935  hypothetical protein  47.37 
 
 		 90 aa  84  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.795864  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2917  hypothetical protein  60.87 
 
 		 84 aa  84  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.862357  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1907  hypothetical protein  51.35 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0497994 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1777  hypothetical protein  56.72 
 
 		 84 aa  80.5  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.256897  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1574  hypothetical protein  57.97 
 
 		 82 aa  79.3  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2916  hypothetical protein  55.07 
 
 		 82 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.480647  normal  0.0883091 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2919  hypothetical protein  53.33 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4037  hypothetical protein  53.62 
 
 		 82 aa  73.9  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0386053 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3327  hypothetical protein  53.62 
 
 		 82 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86974  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2375  hypothetical protein  53.62 
 
 		 73 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0792048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3433  hypothetical protein  46.67 
 
 		 77 aa  70.5  0.000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.14303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3249  hypothetical protein  55.36 
 
 		 71 aa  63.5  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0322757  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4275  hypothetical protein  40 
 
 		 79 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.532653  normal  0.601848 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0811  hypothetical protein  46.48 
 
 		 77 aa  59.3  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1209  hypothetical protein  36.84 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0949  hypothetical protein  37.68 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000000036055  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1958  hypothetical protein  32.76 
 
 		 80 aa  52.8  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000377235  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2643  hypothetical protein  40.62 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2603  hypothetical protein  33.33 
 
 		 80 aa  50.4  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.355164  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3483  hypothetical protein  34.29 
 
 		 84 aa  46.2  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4993  hypothetical protein  35.62 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.819538  normal  0.0403555 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0011  hypothetical protein  32.88 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.808442  normal  0.0183228 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0010  hypothetical protein  32.88 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2822  hypothetical protein  39.62 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.821757  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>