More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1196 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1222  amidophosphoribosyltransferase  93.64 
 
 		 472 aa  928    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.433131  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1415  amidophosphoribosyltransferase  93.64 
 
 		 472 aa  926    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1196  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 		 472 aa  978    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3743  amidophosphoribosyltransferase  57.11 
 
 		 466 aa  535  1e-151  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189021 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4571  amidophosphoribosyltransferase  56.44 
 
 		 468 aa  532  1e-150  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.470676  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1511  amidophosphoribosyltransferase  57.11 
 
 		 466 aa  533  1e-150  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.409813  normal  0.0292739 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1766  amidophosphoribosyltransferase  57.02 
 
 		 488 aa  529  1e-149  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0501857 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  53.24 
 
 		 469 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3343  amidophosphoribosyltransferase  51.74 
 
 		 502 aa  498  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0997  amidophosphoribosyltransferase  51.84 
 
 		 482 aa  499  1e-140  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.421996  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3588  amidophosphoribosyltransferase  52.64 
 
 		 503 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.51846 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  51.74 
 
 		 488 aa  495  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2047  amidophosphoribosyltransferase  51.67 
 
 		 465 aa  494  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.330153 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1475  amidophosphoribosyltransferase  52.44 
 
 		 472 aa  496  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3396  amidophosphoribosyltransferase  50.76 
 
 		 492 aa  488  1e-137  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4178  amidophosphoribosyltransferase  51.51 
 
 		 494 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4318  amidophosphoribosyltransferase  51.84 
 
 		 496 aa  488  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0731  amidophosphoribosyltransferase  51.32 
 
 		 478 aa  490  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2365  amidophosphoribosyltransferase  52.62 
 
 		 474 aa  491  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4217  amidophosphoribosyltransferase  51.51 
 
 		 494 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3637  amidophosphoribosyltransferase  51.29 
 
 		 499 aa  486  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.811729 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1939  amidophosphoribosyltransferase  51.79 
 
 		 466 aa  485  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2908  amidophosphoribosyltransferase  51.86 
 
 		 515 aa  486  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.60952  normal  0.814875 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2702  amidophosphoribosyltransferase  52.1 
 
 		 475 aa  484  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0004  amidophosphoribosyltransferase  50.75 
 
 		 493 aa  483  1e-135  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.645305  normal  0.0907172 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2352  amidophosphoribosyltransferase  49.58 
 
 		 513 aa  482  1e-135  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.10246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08960  amidophosphoribosyltransferase  50.88 
 
 		 496 aa  483  1e-135  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3699  amidophosphoribosyltransferase  50.54 
 
 		 493 aa  484  1e-135  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.549743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2072  amidophosphoribosyltransferase  49.06 
 
 		 506 aa  481  1e-135  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4316  amidophosphoribosyltransferase  50 
 
 		 514 aa  482  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2068  amidophosphoribosyltransferase  52 
 
 		 474 aa  482  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.286768  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34090  amidophosphoribosyltransferase  50 
 
 		 515 aa  484  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.163094 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2184  amidophosphoribosyltransferase  50.22 
 
 		 487 aa  479  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2747  amidophosphoribosyltransferase  50.88 
 
 		 484 aa  479  1e-134  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4387  amidophosphoribosyltransferase  51.84 
 
 		 500 aa  480  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4758  amidophosphoribosyltransferase  50.89 
 
 		 512 aa  480  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1778  hypothetical protein  49.23 
 
 		 475 aa  479  1e-134  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000929805  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8991  amidophosphoribosyltransferase  49.78 
 
 		 478 aa  481  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3089  amidophosphoribosyltransferase  50.43 
 
 		 515 aa  476  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1153  amidophosphoribosyltransferase  50.76 
 
 		 474 aa  476  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3516  amidophosphoribosyltransferase  49.68 
 
 		 517 aa  475  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0309  amidophosphoribosyltransferase  53.33 
 
 		 473 aa  471  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2329  amidophosphoribosyltransferase  50.22 
 
 		 477 aa  473  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.64237  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0724  amidophosphoribosyltransferase  48.4 
 
 		 500 aa  474  1e-132  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00225283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06050  amidophosphoribosyltransferase  49.45 
 
 		 518 aa  472  1e-132  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.203247  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1891  amidophosphoribosyltransferase  50.43 
 
 		 477 aa  473  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1636  amidophosphoribosyltransferase  50.9 
 
 		 467 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  48.58 
 
 		 474 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3474  amidophosphoribosyltransferase  50.22 
 
 		 563 aa  469  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0824  amidophosphoribosyltransferase  52.12 
 
 		 488 aa  471  1.0000000000000001e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0296  amidophosphoribosyltransferase  49.57 
 
 		 505 aa  469  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4041  amidophosphoribosyltransferase  47.11 
 
 		 514 aa  468  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.181918  normal  0.175272 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5049  amidophosphoribosyltransferase  49.89 
 
 		 534 aa  466  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4621  amidophosphoribosyltransferase  48.69 
 
 		 482 aa  465  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.059877  normal  0.48412 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1032  amidophosphoribosyltransferase  51 
 
 		 495 aa  466  9.999999999999999e-131  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0324  amidophosphoribosyltransferase  48.33 
 
 		 471 aa  461  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  48.33 
 
 		 471 aa  461  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0163  amidophosphoribosyltransferase  50 
 
 		 526 aa  464  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124827  hitchhiker  0.000251042 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6142  amidophosphoribosyltransferase  50.66 
 
 		 519 aa  464  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0368  amidophosphoribosyltransferase  48.33 
 
 		 471 aa  461  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0154  amidophosphoribosyltransferase  49.78 
 
 		 526 aa  464  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.66132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3735  amidophosphoribosyltransferase  49.78 
 
 		 558 aa  465  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0007  amidophosphoribosyltransferase  50.66 
 
 		 487 aa  464  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0522  amidophosphoribosyltransferase  48.46 
 
 		 465 aa  465  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0341  amidophosphoribosyltransferase  48.11 
 
 		 471 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  48.67 
 
 		 471 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  48.67 
 
 		 471 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  48.67 
 
 		 471 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0033  amidophosphoribosyltransferase  49.78 
 
 		 497 aa  459  9.999999999999999e-129  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  48.67 
 
 		 471 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0327  amidophosphoribosyltransferase  48.67 
 
 		 471 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01750  amidophosphoribosyltransferase  49.24 
 
 		 482 aa  459  9.999999999999999e-129  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.674101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0276  amidophosphoribosyltransferase  48.67 
 
 		 471 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37880  amidophosphoribosyltransferase  48.46 
 
 		 512 aa  461  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.458178 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6859  amidophosphoribosyltransferase  49.11 
 
 		 525 aa  459  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1136  amidophosphoribosyltransferase  48.79 
 
 		 470 aa  457  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4924  amidophosphoribosyltransferase  48.71 
 
 		 511 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1389  amidophosphoribosyltransferase  49.12 
 
 		 479 aa  457  1e-127  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.254172  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1326  amidophosphoribosyltransferase  49.67 
 
 		 468 aa  456  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0274  amidophosphoribosyltransferase  48.55 
 
 		 471 aa  458  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2179  amidophosphoribosyltransferase  48.13 
 
 		 462 aa  457  1e-127  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1634  amidophosphoribosyltransferase  48.06 
 
 		 511 aa  455  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4541  amidophosphoribosyltransferase  48.71 
 
 		 511 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4628  amidophosphoribosyltransferase  48.71 
 
 		 511 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5114  amidophosphoribosyltransferase  48.6 
 
 		 510 aa  457  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0638191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2109  amidophosphoribosyltransferase  50.33 
 
 		 475 aa  455  1e-127  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0878  glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase  49 
 
 		 503 aa  456  1e-127  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141495  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4354  amidophosphoribosyltransferase  51.31 
 
 		 484 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.463043 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1147  amidophosphoribosyltransferase  47.68 
 
 		 478 aa  452  1.0000000000000001e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.218005  normal  0.314166 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3576  amidophosphoribosyltransferase  47.42 
 
 		 517 aa  452  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.538903  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0300  amidophosphoribosyltransferase  48.18 
 
 		 498 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0948  amidophosphoribosyltransferase  47.57 
 
 		 525 aa  452  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4361  amidophosphoribosyltransferase  49.78 
 
 		 485 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0004  amidophosphoribosyltransferase  47.83 
 
 		 501 aa  450  1e-125  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0983  amidophosphoribosyltransferase  49.23 
 
 		 490 aa  451  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.592161  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18600  amidophosphoribosyltransferase  49.46 
 
 		 537 aa  448  1e-125  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0398  amidophosphoribosyltransferase  48.88 
 
 		 480 aa  451  1e-125  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10823  amidophosphoribosyltransferase  47.56 
 
 		 527 aa  451  1e-125  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.230334 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4338  amidophosphoribosyltransferase  49.78 
 
 		 485 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2807  amidophosphoribosyltransferase  49.55 
 
 		 462 aa  450  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>