47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1370 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1370  protein of unknown function DUF1304  100 
 
 		 120 aa  239  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0191403  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1349  protein of unknown function DUF1304  68.22 
 
 		 120 aa  153  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3957  protein of unknown function DUF1304  62.71 
 
 		 120 aa  151  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4838  hypothetical protein  55.93 
 
 		 123 aa  128  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1910  hypothetical protein  56.19 
 
 		 124 aa  119  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.724765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2464  protein of unknown function DUF1304  58.1 
 
 		 116 aa  115  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283344  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1973  hypothetical protein  54.24 
 
 		 116 aa  116  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1051  hypothetical protein  53.98 
 
 		 123 aa  114  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.555272  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1367  hypothetical protein  52.68 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000537574 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7649  hypothetical protein  50.85 
 
 		 119 aa  111  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0648  hypothetical protein  50.93 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0699  protein of unknown function DUF1304  54.37 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455556  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0037  hypothetical protein  53.7 
 
 		 122 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1841  hypothetical protein  47.06 
 
 		 123 aa  101  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.995737 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3402  hypothetical protein  47.06 
 
 		 123 aa  101  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6325  protein of unknown function DUF1304  51.82 
 
 		 129 aa  99.8  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4228  protein of unknown function DUF1304  46.96 
 
 		 120 aa  99.4  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.728576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4116  protein of unknown function DUF1304  46.96 
 
 		 120 aa  99.4  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.532223  normal  0.15572 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0975  hypothetical protein  46.49 
 
 		 123 aa  95.9  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000480438  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0584  protein of unknown function DUF1304  53.7 
 
 		 120 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2834  hypothetical protein  48.72 
 
 		 117 aa  95.1  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.931347  hitchhiker  0.00331454 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0989  hypothetical protein  45.61 
 
 		 123 aa  94.4  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1160  hypothetical protein  45.61 
 
 		 123 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1223  hypothetical protein  45.61 
 
 		 123 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1059  hypothetical protein  45.61 
 
 		 123 aa  94.4  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0977  hypothetical protein  45.61 
 
 		 123 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.47495  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05690  hypothetical protein  43.1 
 
 		 120 aa  94  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04765  hypothetical protein  43.1 
 
 		 120 aa  94  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1143  hypothetical protein  45.61 
 
 		 123 aa  94  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3066  protein of unknown function DUF1304  50 
 
 		 116 aa  92  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.269223 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3500  hypothetical protein  55.56 
 
 		 120 aa  92.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.395821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01662  hypothetical protein  52.29 
 
 		 117 aa  90.1  9e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1871  hypothetical protein  53.4 
 
 		 118 aa  84.3  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.33795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1705  protein of unknown function DUF1304  46.49 
 
 		 117 aa  83.6  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.449523  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1971  hypothetical protein  41.38 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000233421  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0949  hypothetical protein  36.21 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.996626  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1561  hypothetical protein  39.32 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.513127  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1637  hypothetical protein  37.4 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0443  hypothetical protein  35.04 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2133  hypothetical protein  38.98 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0455  hypothetical protein  35.04 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.720124  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1034  hypothetical protein  36.04 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0608505  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1666  hypothetical protein  35.04 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1508  hypothetical protein  44.14 
 
 		 117 aa  60.1  0.000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08980  predicted membrane protein  39.66 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.482637 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2180  protein of unknown function DUF1304  44.74 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.299642  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0073  protein of unknown function DUF1304  38.1 
 
 		 126 aa  40  0.01  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>