50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0564 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0589  tubulin/FtsZ family protein  98.72 
 
 		 392 aa  801    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000157682  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0564  tubulin/FtsZ, GTPase  100 
 
 		 392 aa  806    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000265914  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_529  GTPase domain, tubulin/FtsZ  98.72 
 
 		 392 aa  801    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000114898  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1054  tubulin/FtsZ family protein  55.27 
 
 		 379 aa  396  1e-109  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0748006  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0933  tubulin/FtsZ, GTPase  54.76 
 
 		 379 aa  396  1e-109  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.013104  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_922  FtsZ-like protein  54.5 
 
 		 379 aa  395  1e-108  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00585764  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0639  Tubulin/FtsZ GTPase  31.71 
 
 		 392 aa  150  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2630  Tubulin/FtsZ GTPase  32.25 
 
 		 392 aa  150  5e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1412  Tubulin/FtsZ GTPase  31.25 
 
 		 394 aa  147  3e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.105348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1300  Tubulin/FtsZ GTPase  30.94 
 
 		 392 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.620908  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1892  Tubulin/FtsZ GTPase  32.68 
 
 		 392 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.122904  normal  0.513401 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0004  Tubulin/FtsZ GTPase  30.33 
 
 		 434 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0345079  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0726  tubulin/FtsZ, GTPase  29.38 
 
 		 388 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00716744  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0518  Tubulin/FtsZ GTPase  27.71 
 
 		 388 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0620842  normal  0.866363 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1596  tubulin/FtsZ, GTPase  28.9 
 
 		 393 aa  126  5e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.241888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0522  Tubulin/FtsZ GTPase  28.75 
 
 		 393 aa  124  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0695  tubulin/FtsZ, GTPase  29.26 
 
 		 396 aa  123  6e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.954688  normal  0.243213 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1491  AIR synthase related protein  29.66 
 
 		 397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.570422  normal  0.0235586 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1200  Tubulin/FtsZ GTPase  28.27 
 
 		 359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0390172  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1348  Tubulin/FtsZ GTPase  28.81 
 
 		 362 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3060  Tubulin/FtsZ GTPase  28.53 
 
 		 358 aa  108  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.98064  normal  0.91735 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2614  Tubulin/FtsZ GTPase  27.42 
 
 		 360 aa  107  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0198  Tubulin/FtsZ GTPase  28.5 
 
 		 359 aa  107  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.691776 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0239  tubulin/FtsZ, GTPase  26.35 
 
 		 367 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1684  tubulin/FtsZ, GTPase  31.22 
 
 		 368 aa  76.3  0.0000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0531719  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0527  cell division GTPase-like protein  23.65 
 
 		 765 aa  72  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.842807  normal  0.414486 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0556  cell division GTPase-like protein  24.16 
 
 		 651 aa  69.7  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0745283  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2673  Tubulin/FtsZ GTPase  25.26 
 
 		 410 aa  69.7  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.662506 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2258  cell division GTPase-like  24.45 
 
 		 381 aa  69.7  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3616  Tubulin/FtsZ GTPase  23.77 
 
 		 381 aa  65.9  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0069  hypothetical protein  23 
 
 		 648 aa  59.7  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000146951 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1688  Tubulin/FtsZ GTPase  22.25 
 
 		 389 aa  55.8  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2283  Tubulin/FtsZ GTPase  28.05 
 
 		 360 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.781694  normal  0.248572 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0698  Tubulin/FtsZ GTPase  22.42 
 
 		 384 aa  48.9  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.175752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119480  gamma tubulin  23.67 
 
 		 449 aa  47  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.171432  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44225  predicted protein  24.41 
 
 		 468 aa  46.6  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.768572  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2641  cell division protein FtsZ  33.33 
 
 		 431 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.389094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0660  cell division protein FtsZ  27.94 
 
 		 362 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00000000171768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2517  cell division protein FtsZ  28.02 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0363  cell division protein FtsZ  22.6 
 
 		 371 aa  45.4  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000281943  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0894  cell division protein FtsZ  28.42 
 
 		 422 aa  45.1  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00676  Tubulin gamma chain (Gamma-tubulin) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P18695]  25.44 
 
 		 454 aa  44.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.372387  normal  0.509658 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2172  cell division protein FtsZ  33.33 
 
 		 513 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0335477  normal  0.0236284 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3943  cell division protein FtsZ  28.57 
 
 		 400 aa  43.9  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3818  cell division protein FtsZ  28.73 
 
 		 378 aa  43.9  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3745  cell division protein FtsZ  28.73 
 
 		 378 aa  43.9  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0151  cell division protein FtsZ  33.1 
 
 		 361 aa  43.5  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000169065  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2716  cell division protein FtsZ  27.62 
 
 		 431 aa  43.5  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0707942  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0964  cell division protein FtsZ  31.29 
 
 		 370 aa  43.5  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28162  Gamma tubulin  26.55 
 
 		 375 aa  43.1  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0897404  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>