29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0556 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0556  cell division GTPase-like protein  100 
 
 
651 aa  1316    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0745283  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2673  Tubulin/FtsZ GTPase  48.76 
 
 
410 aa  384  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.662506 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0527  cell division GTPase-like protein  50.13 
 
 
765 aa  375  1e-102  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.842807  normal  0.414486 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0069  hypothetical protein  46.72 
 
 
648 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.000146951 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2258  cell division GTPase-like  40.27 
 
 
381 aa  271  4e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1491  AIR synthase related protein  32.68 
 
 
397 aa  210  7e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.570422  normal  0.0235586 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0726  tubulin/FtsZ, GTPase  31.01 
 
 
388 aa  204  4e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00716744  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0695  tubulin/FtsZ, GTPase  29.88 
 
 
396 aa  203  9e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.954688  normal  0.243213 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0518  Tubulin/FtsZ GTPase  30.33 
 
 
388 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0620842  normal  0.866363 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1892  Tubulin/FtsZ GTPase  31.93 
 
 
392 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.122904  normal  0.513401 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1300  Tubulin/FtsZ GTPase  30.45 
 
 
392 aa  191  4e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.620908  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1596  tubulin/FtsZ, GTPase  30.31 
 
 
393 aa  189  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.241888  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0639  Tubulin/FtsZ GTPase  29.78 
 
 
392 aa  182  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1412  Tubulin/FtsZ GTPase  30.15 
 
 
394 aa  181  4e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.105348  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2630  Tubulin/FtsZ GTPase  29.6 
 
 
392 aa  179  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0004  Tubulin/FtsZ GTPase  28.89 
 
 
434 aa  168  2.9999999999999998e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0345079  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0522  Tubulin/FtsZ GTPase  28.83 
 
 
393 aa  147  6e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1348  Tubulin/FtsZ GTPase  27.75 
 
 
362 aa  127  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2614  Tubulin/FtsZ GTPase  27.95 
 
 
360 aa  127  8.000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0198  Tubulin/FtsZ GTPase  29.86 
 
 
359 aa  117  5e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.691776 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3060  Tubulin/FtsZ GTPase  30.52 
 
 
358 aa  117  5e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.98064  normal  0.91735 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1200  Tubulin/FtsZ GTPase  28.06 
 
 
359 aa  110  9.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0390172  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1688  Tubulin/FtsZ GTPase  23.36 
 
 
389 aa  72  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3616  Tubulin/FtsZ GTPase  23.56 
 
 
381 aa  70.1  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0698  Tubulin/FtsZ GTPase  24.54 
 
 
384 aa  67.8  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.175752  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_529  GTPase domain, tubulin/FtsZ  23.85 
 
 
392 aa  64.3  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000114898  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0589  tubulin/FtsZ family protein  23.85 
 
 
392 aa  64.3  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000157682  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0564  tubulin/FtsZ, GTPase  23.33 
 
 
392 aa  62.8  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000265914  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1684  tubulin/FtsZ, GTPase  20.34 
 
 
368 aa  50.1  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0531719  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>