48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_922 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1054  tubulin/FtsZ family protein  97.36 
 
 		 379 aa  735    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0748006  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_922  FtsZ-like protein  100 
 
 		 379 aa  776    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00585764  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0933  tubulin/FtsZ, GTPase  97.36 
 
 		 379 aa  738    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.013104  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0589  tubulin/FtsZ family protein  54.5 
 
 		 392 aa  396  1e-109  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000157682  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_529  GTPase domain, tubulin/FtsZ  54.5 
 
 		 392 aa  396  1e-109  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000114898  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0564  tubulin/FtsZ, GTPase  54.5 
 
 		 392 aa  396  1e-109  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000265914  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1300  Tubulin/FtsZ GTPase  32.95 
 
 		 392 aa  127  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.620908  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1892  Tubulin/FtsZ GTPase  32.48 
 
 		 392 aa  125  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.122904  normal  0.513401 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2630  Tubulin/FtsZ GTPase  32.56 
 
 		 392 aa  123  4e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0639  Tubulin/FtsZ GTPase  30.49 
 
 		 392 aa  123  7e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0726  tubulin/FtsZ, GTPase  30.38 
 
 		 388 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00716744  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0004  Tubulin/FtsZ GTPase  29.83 
 
 		 434 aa  116  5e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0345079  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0695  tubulin/FtsZ, GTPase  30.26 
 
 		 396 aa  116  6e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.954688  normal  0.243213 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0518  Tubulin/FtsZ GTPase  31 
 
 		 388 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0620842  normal  0.866363 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1596  tubulin/FtsZ, GTPase  29.95 
 
 		 393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.241888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1412  Tubulin/FtsZ GTPase  30.99 
 
 		 394 aa  114  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.105348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1491  AIR synthase related protein  29.94 
 
 		 397 aa  108  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.570422  normal  0.0235586 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3060  Tubulin/FtsZ GTPase  28.85 
 
 		 358 aa  106  6e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.98064  normal  0.91735 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0198  Tubulin/FtsZ GTPase  28.69 
 
 		 359 aa  105  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.691776 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1200  Tubulin/FtsZ GTPase  28.09 
 
 		 359 aa  103  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0390172  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1348  Tubulin/FtsZ GTPase  28.29 
 
 		 362 aa  103  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2614  Tubulin/FtsZ GTPase  28.17 
 
 		 360 aa  102  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0522  Tubulin/FtsZ GTPase  27.57 
 
 		 393 aa  96.7  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1684  tubulin/FtsZ, GTPase  27.96 
 
 		 368 aa  86.3  9e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0531719  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0239  tubulin/FtsZ, GTPase  33.66 
 
 		 367 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3616  Tubulin/FtsZ GTPase  23.36 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2673  Tubulin/FtsZ GTPase  23.37 
 
 		 410 aa  55.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.662506 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1688  Tubulin/FtsZ GTPase  22.55 
 
 		 389 aa  53.1  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2283  Tubulin/FtsZ GTPase  27.27 
 
 		 360 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.781694  normal  0.248572 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0069  hypothetical protein  23.28 
 
 		 648 aa  50.8  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000146951 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0527  cell division GTPase-like protein  23.05 
 
 		 765 aa  47.4  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.842807  normal  0.414486 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0901  cell division protein FtsZ  32.61 
 
 		 386 aa  47  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.363847 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2517  cell division protein FtsZ  26.17 
 
 		 420 aa  47.4  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1373  cell division protein FtsZ  32.16 
 
 		 392 aa  46.6  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0059  cell division protein FtsZ  25.94 
 
 		 427 aa  46.6  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000225371  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0151  cell division protein FtsZ  30.6 
 
 		 361 aa  45.8  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000169065  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0556  cell division GTPase-like protein  22.53 
 
 		 651 aa  45.8  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0745283  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0890  cell division protein FtsZ  29.03 
 
 		 368 aa  45.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0281194  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2780  cell division protein FtsZ  30.65 
 
 		 381 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2890  cell division protein FtsZ  25.47 
 
 		 430 aa  44.7  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000804366  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2716  cell division protein FtsZ  26.97 
 
 		 431 aa  44.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0707942  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0342  cell division protein FtsZ  29.91 
 
 		 372 aa  44.7  0.003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.000000128009  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0660  cell division protein FtsZ  30.56 
 
 		 362 aa  44.3  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00000000171768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0894  cell division protein FtsZ  29.93 
 
 		 422 aa  44.3  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0409  cell division protein FtsZ  29.44 
 
 		 365 aa  43.9  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.233914  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2105  cell division protein FtsZ  25.35 
 
 		 436 aa  44.3  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.535546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2935  cell division protein FtsZ  30.65 
 
 		 389 aa  43.9  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0789776  normal  0.871728 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2498  cell division protein FtsZ  25.47 
 
 		 430 aa  43.1  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.103789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>