51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1054 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1054  tubulin/FtsZ family protein  100 
 
 
379 aa  776    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0748006  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_922  FtsZ-like protein  97.36 
 
 
379 aa  736    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00585764  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0933  tubulin/FtsZ, GTPase  96.31 
 
 
379 aa  733    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.013104  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0589  tubulin/FtsZ family protein  55.27 
 
 
392 aa  398  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000157682  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_529  GTPase domain, tubulin/FtsZ  55.27 
 
 
392 aa  398  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000114898  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0564  tubulin/FtsZ, GTPase  55.27 
 
 
392 aa  398  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000265914  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1300  Tubulin/FtsZ GTPase  33.91 
 
 
392 aa  129  8.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.620908  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1892  Tubulin/FtsZ GTPase  33.05 
 
 
392 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.122904  normal  0.513401 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2630  Tubulin/FtsZ GTPase  32.85 
 
 
392 aa  126  7e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0639  Tubulin/FtsZ GTPase  30.49 
 
 
392 aa  124  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0726  tubulin/FtsZ, GTPase  30.11 
 
 
388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00716744  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1412  Tubulin/FtsZ GTPase  32.17 
 
 
394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.105348  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0695  tubulin/FtsZ, GTPase  29.29 
 
 
396 aa  117  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.954688  normal  0.243213 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0518  Tubulin/FtsZ GTPase  30.91 
 
 
388 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0620842  normal  0.866363 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0004  Tubulin/FtsZ GTPase  29.28 
 
 
434 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0345079  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1596  tubulin/FtsZ, GTPase  29.68 
 
 
393 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.241888  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1491  AIR synthase related protein  30.31 
 
 
397 aa  110  3e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.570422  normal  0.0235586 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3060  Tubulin/FtsZ GTPase  28.57 
 
 
358 aa  109  8.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.98064  normal  0.91735 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0198  Tubulin/FtsZ GTPase  28.41 
 
 
359 aa  105  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.691776 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1348  Tubulin/FtsZ GTPase  28.01 
 
 
362 aa  103  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1200  Tubulin/FtsZ GTPase  27.81 
 
 
359 aa  102  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0390172  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2614  Tubulin/FtsZ GTPase  27.89 
 
 
360 aa  100  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0522  Tubulin/FtsZ GTPase  27.3 
 
 
393 aa  94.7  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1684  tubulin/FtsZ, GTPase  30.21 
 
 
368 aa  84  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0531719  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0239  tubulin/FtsZ, GTPase  34.15 
 
 
367 aa  79  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3616  Tubulin/FtsZ GTPase  23.1 
 
 
381 aa  68.9  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2673  Tubulin/FtsZ GTPase  23.37 
 
 
410 aa  54.7  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.662506 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2283  Tubulin/FtsZ GTPase  26.45 
 
 
360 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.781694  normal  0.248572 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1688  Tubulin/FtsZ GTPase  23.08 
 
 
389 aa  51.2  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0901  cell division protein FtsZ  34.78 
 
 
386 aa  49.7  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.363847 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0890  cell division protein FtsZ  30.11 
 
 
368 aa  49.3  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0281194  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1373  cell division protein FtsZ  32.32 
 
 
392 aa  48.9  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2517  cell division protein FtsZ  25.21 
 
 
420 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0342  cell division protein FtsZ  31.31 
 
 
372 aa  48.1  0.0002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.000000128009  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0527  cell division GTPase-like protein  23.71 
 
 
765 aa  48.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.842807  normal  0.414486 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0069  hypothetical protein  23.16 
 
 
648 aa  48.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.000146951 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2780  cell division protein FtsZ  31.82 
 
 
381 aa  47.4  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2716  cell division protein FtsZ  27.53 
 
 
431 aa  46.6  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0707942  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0059  cell division protein FtsZ  25.94 
 
 
427 aa  46.2  0.0009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000225371  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0556  cell division GTPase-like protein  22.53 
 
 
651 aa  45.8  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0745283  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0660  cell division protein FtsZ  30.56 
 
 
362 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00000000171768  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0894  cell division protein FtsZ  30.61 
 
 
422 aa  45.4  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2935  cell division protein FtsZ  30.65 
 
 
389 aa  45.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0789776  normal  0.871728 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2890  cell division protein FtsZ  25.47 
 
 
430 aa  44.7  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000804366  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2105  cell division protein FtsZ  25.23 
 
 
436 aa  44.3  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.535546  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0409  cell division protein FtsZ  30 
 
 
365 aa  44.3  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.233914  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0151  cell division protein FtsZ  32.72 
 
 
361 aa  43.9  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000169065  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44225  predicted protein  30.25 
 
 
468 aa  43.1  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.768572  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2498  cell division protein FtsZ  25.47 
 
 
430 aa  42.7  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.103789  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1942  cell division protein FtsZ  30.39 
 
 
368 aa  42.7  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000000000000184944  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2599  putative cell division protein FtsZ  32.53 
 
 
379 aa  42.7  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.45791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>