23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0909 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0909  HesB/YadR/YfhF-family protein  100 
 
 
106 aa  215  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.614145  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1688  HesB/YadR/YfhF-family protein  62.92 
 
 
107 aa  123  7e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.156984  normal  0.865777 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0158  HesB-like domain-containing protein  56.18 
 
 
106 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0195256 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2018  HesB-like domain-containing protein  60 
 
 
106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000156848  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1886  HesB/YadR/YfhF-family protein  58.43 
 
 
107 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2625  HesB/YadR/YfhF-family protein  51.11 
 
 
108 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.972453 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1878  hypothetical protein  44.12 
 
 
101 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000080584  hitchhiker  0.00286837 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1484  HesB/YadR/YfhF-family protein  40 
 
 
103 aa  69.7  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2865  HesB-like domain-containing protein  40.66 
 
 
106 aa  68.6  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.053706  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0159  HesB-like domain-containing protein  40.45 
 
 
97 aa  67.8  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0136748 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1687  HesB-like domain-containing protein  38.89 
 
 
100 aa  61.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.212563  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1879  hypothetical protein  35.56 
 
 
104 aa  60.5  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000257443  hitchhiker  0.00124508 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2020  HesB family selenoprotein  46 
 
 
64 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000452157  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0908  HesB/YadR/YfhF-family protein  53.33 
 
 
46 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.515957  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2019  hypothetical protein  59.38 
 
 
64 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000993127  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6870  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.95 
 
 
206 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1041  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.22 
 
 
117 aa  44.7  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0907  HesB/YadR/YfhF-family protein  54.84 
 
 
31 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.341762  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1787  HesB/YadR/YfhF  31.58 
 
 
107 aa  42  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0641  HesB-related selenoprotein  30.14 
 
 
108 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01610  Nitrogen fixation Fe-S cluster assembly protein IscAnif  32.1 
 
 
107 aa  41.2  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0653  hesB family protein  30.14 
 
 
108 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5062  HesB/YadR/YfhF-family protein  34.62 
 
 
99 aa  40.4  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589222  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>