27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2018 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2018  HesB-like domain-containing protein  100 
 
 
106 aa  212  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000156848  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2625  HesB/YadR/YfhF-family protein  62.64 
 
 
108 aa  124  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.972453 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1886  HesB/YadR/YfhF-family protein  65.17 
 
 
107 aa  120  7e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0909  HesB/YadR/YfhF-family protein  60 
 
 
106 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.614145  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1688  HesB/YadR/YfhF-family protein  57.3 
 
 
107 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.156984  normal  0.865777 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0158  HesB-like domain-containing protein  53.93 
 
 
106 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0195256 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1687  HesB-like domain-containing protein  46.67 
 
 
100 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.212563  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1878  hypothetical protein  48.04 
 
 
101 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000080584  hitchhiker  0.00286837 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0159  HesB-like domain-containing protein  43.82 
 
 
97 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0136748 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2865  HesB-like domain-containing protein  46.15 
 
 
106 aa  77  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.053706  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1484  HesB/YadR/YfhF-family protein  38.82 
 
 
103 aa  68.6  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1879  hypothetical protein  37.78 
 
 
104 aa  62.8  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000257443  hitchhiker  0.00124508 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2019  hypothetical protein  62.5 
 
 
64 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000993127  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01610  Nitrogen fixation Fe-S cluster assembly protein IscAnif  34.23 
 
 
107 aa  46.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0907  HesB/YadR/YfhF-family protein  61.29 
 
 
31 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.341762  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2020  HesB family selenoprotein  40 
 
 
64 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000452157  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0908  HesB/YadR/YfhF-family protein  54.76 
 
 
46 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.515957  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1041  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  31.78 
 
 
117 aa  43.5  0.0009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1950  HesB/YadR/YfhF-family protein  30.3 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.550426  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3536  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  30.28 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0677815  hitchhiker  0.00231818 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4453  HesB/YadR/YfhF  36.04 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0666  HesB family selenoprotein  34 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000254552  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2652  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  28.44 
 
 
105 aa  40.8  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.758195  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2694  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  30.48 
 
 
147 aa  40.8  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000130443  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3304  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  29.36 
 
 
120 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0556  HesB/YadR/YfhF  30.12 
 
 
113 aa  40.4  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.208955  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4034  hypothetical protein  31.58 
 
 
69 aa  40  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>