22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1688 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1688  HesB/YadR/YfhF-family protein  100 
 
 		 107 aa  216  6e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.156984  normal  0.865777 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0158  HesB-like domain-containing protein  77.53 
 
 		 106 aa  150  5e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0195256 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0909  HesB/YadR/YfhF-family protein  62.92 
 
 		 106 aa  120  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.614145  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1886  HesB/YadR/YfhF-family protein  66.27 
 
 		 107 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2018  HesB-like domain-containing protein  57.3 
 
 		 106 aa  104  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000156848  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2625  HesB/YadR/YfhF-family protein  51.69 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.972453 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0159  HesB-like domain-containing protein  40.66 
 
 		 97 aa  80.5  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0136748 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2020  HesB family selenoprotein  66 
 
 		 64 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000452157  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1878  hypothetical protein  42.99 
 
 		 101 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000080584  hitchhiker  0.00286837 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1484  HesB/YadR/YfhF-family protein  42.53 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2865  HesB-like domain-containing protein  42.35 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.053706  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2019  hypothetical protein  84.38 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000993127  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1687  HesB-like domain-containing protein  34.83 
 
 		 100 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.212563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1879  hypothetical protein  40.48 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000257443  hitchhiker  0.00124508 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0907  HesB/YadR/YfhF-family protein  67.74 
 
 		 31 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.341762  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6870  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  35.23 
 
 		 206 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0908  HesB/YadR/YfhF-family protein  48.89 
 
 		 46 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.515957  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1950  HesB/YadR/YfhF-family protein  33.33 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.550426  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4034  hypothetical protein  38.78 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0641  HesB-related selenoprotein  31.94 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0653  hesB family protein  31.94 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1787  HesB/YadR/YfhF  32.05 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>