22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0320 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0320  protein of unknown function DUF169  100 
 
 
284 aa  589  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.129666  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2166  protein of unknown function DUF169  64.62 
 
 
281 aa  386  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1444  protein of unknown function DUF169  52.71 
 
 
281 aa  293  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2491  hypothetical protein  51.64 
 
 
296 aa  288  9e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.785012  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2533  hypothetical protein  41.03 
 
 
285 aa  217  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0915  hypothetical protein  34.6 
 
 
258 aa  126  5e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.155446  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1527  hypothetical protein  31.2 
 
 
250 aa  102  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1649  hypothetical protein  35.53 
 
 
274 aa  85.9  7e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.140534  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2252  protein of unknown function DUF169  26.46 
 
 
238 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0116  protein of unknown function DUF169  32.41 
 
 
265 aa  79  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011799  hitchhiker  0.00705283 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0039  hypothetical protein  33.33 
 
 
267 aa  75.5  0.0000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3174  hypothetical protein  32.43 
 
 
273 aa  75.5  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2893  hypothetical protein  32.9 
 
 
272 aa  69.3  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.362582  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1376  hypothetical protein  26.52 
 
 
273 aa  67  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59451  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2259  hypothetical protein  24.35 
 
 
260 aa  58.9  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0386104 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2260  hypothetical protein  25.64 
 
 
279 aa  54.7  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.087732 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2481  hypothetical protein  24.01 
 
 
274 aa  54.3  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.287343 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0406  hypothetical protein  23.12 
 
 
257 aa  50.4  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3015  hypothetical protein  25.82 
 
 
262 aa  50.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.667221  normal  0.0266748 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1049  hypothetical protein  25.32 
 
 
232 aa  48.9  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.931099  normal  0.654081 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0407  hypothetical protein  20.68 
 
 
279 aa  48.9  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0332  hypothetical protein  22.58 
 
 
278 aa  46.2  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>