23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0016 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0016  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  194  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0031  hypothetical protein  69.15 
 
 
307 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2041  protein of unknown function DUF116  69.88 
 
 
354 aa  122  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0017  protein of unknown function DUF116  72.15 
 
 
298 aa  120  6e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0013  protein of unknown function DUF116  78.87 
 
 
291 aa  120  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.877315  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2842  protein of unknown function DUF116  70.42 
 
 
268 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.833781  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0149  hypothetical protein  69.12 
 
 
267 aa  102  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.691923  normal  0.569731 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0636  protein of unknown function DUF116  63.24 
 
 
259 aa  100  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.62091  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0899  hypothetical protein  53.76 
 
 
269 aa  99.8  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.613511  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0650  protein of unknown function DUF116  63.24 
 
 
256 aa  100  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.03585e-24 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0820  hypothetical protein  61.76 
 
 
256 aa  97.8  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3218  protein of unknown function DUF116  56.76 
 
 
259 aa  97.8  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2312  protein of unknown function DUF116  57.69 
 
 
262 aa  96.3  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.568933  hitchhiker  0.00168334 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0512  hypothetical protein  61.19 
 
 
258 aa  95.9  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3340  hypothetical protein  57.75 
 
 
251 aa  95.1  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0131  hypothetical protein  56.34 
 
 
251 aa  94.7  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0243  hypothetical protein  56.34 
 
 
275 aa  93.6  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1754  hypothetical protein  54.41 
 
 
250 aa  90.9  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1335  protein of unknown function DUF116  61.19 
 
 
269 aa  90.5  8e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0220692  normal  0.691762 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1706  hypothetical protein  56.34 
 
 
255 aa  86.3  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1230  hypothetical protein  56.52 
 
 
250 aa  85.9  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00155832  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1530  protein of unknown function DUF116  54.1 
 
 
251 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.17942  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0569  hypothetical protein  48.61 
 
 
251 aa  77  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000609757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>