More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0053 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
112 aa  219  8e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0594  nitrogen regulatory protein P-II  89.29 
 
 
112 aa  201  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  87.5 
 
 
112 aa  198  2e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0433  nitrogen regulatory protein P-II  87.5 
 
 
112 aa  197  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0037358  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0218  nitrogen regulatory protein P-II  86.61 
 
 
112 aa  195  2e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0120  nitrogen regulatory protein P-II  85.71 
 
 
112 aa  193  8e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0183  nitrogen regulatory protein P-II  84.82 
 
 
112 aa  192  9e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  85.71 
 
 
112 aa  192  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0171  nitrogen regulatory protein P-II  87.5 
 
 
112 aa  192  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138781  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  85.71 
 
 
112 aa  192  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0472  nitrogen regulatory protein P-II  86.61 
 
 
112 aa  192  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  85.71 
 
 
112 aa  192  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  83.93 
 
 
112 aa  191  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2827  nitrogen regulatory protein P-II  83.93 
 
 
112 aa  191  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.994537  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0487  nitrogen regulatory protein P-II  83.93 
 
 
112 aa  191  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188054  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3218  P-II family regulatory protein  83.93 
 
 
112 aa  191  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472285  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0468  nitrogen regulatory protein P-II  83.93 
 
 
112 aa  191  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409463  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  83.93 
 
 
136 aa  191  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  83.93 
 
 
112 aa  191  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0193  nitrogen regulatory protein P-II  83.93 
 
 
112 aa  191  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  83.93 
 
 
112 aa  191  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6195  nitrogen regulatory protein P-II  83.93 
 
 
136 aa  191  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  83.93 
 
 
112 aa  191  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  83.93 
 
 
112 aa  191  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  83.93 
 
 
112 aa  191  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  83.93 
 
 
112 aa  191  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  83.93 
 
 
112 aa  191  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  85.71 
 
 
112 aa  191  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  83.93 
 
 
112 aa  191  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0259  nitrogen regulatory protein P-II  83.93 
 
 
112 aa  190  6e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69810  nitrogen regulatory protein P-II 2  83.93 
 
 
112 aa  190  6e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.241854 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6030  nitrogen regulatory protein P-II 2  83.93 
 
 
112 aa  190  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  82.14 
 
 
112 aa  189  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0240  nitrogen regulatory protein P-II  83.04 
 
 
112 aa  189  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3942  nitrogen regulatory protein P-II  86.61 
 
 
112 aa  188  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  84.82 
 
 
112 aa  188  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  83.93 
 
 
112 aa  187  5e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  3.68327e-06 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  83.93 
 
 
112 aa  187  5e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0233  nitrogen regulatory protein P-II  85.71 
 
 
112 aa  186  6e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2406  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 
112 aa  186  9e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0080  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 
112 aa  186  9e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416357  normal  0.780104 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3314  nitrogen regulatory protein P-II  83.04 
 
 
112 aa  186  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258343  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  84.82 
 
 
112 aa  186  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0238  nitrogen regulatory protein P-II  82.14 
 
 
112 aa  184  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0928138  normal  0.898368 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0163  nitrogen regulatory protein P-II  83.93 
 
 
112 aa  185  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.814781 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5295  nitrogen regulatory protein P-II  82.14 
 
 
112 aa  184  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  82.14 
 
 
112 aa  185  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5143  nitrogen regulatory protein P-II  82.14 
 
 
112 aa  184  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2915  nitrogen regulatory protein P-II 2  79.46 
 
 
112 aa  185  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0326538  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5234  nitrogen regulatory protein P-II  82.14 
 
 
112 aa  184  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0190  nitrogen regulatory protein P-II  82.14 
 
 
112 aa  184  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0181  nitrogen regulatory protein P-II  83.93 
 
 
112 aa  185  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.153981  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2530  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 
112 aa  185  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5506  nitrogen regulatory protein P-II  82.14 
 
 
112 aa  184  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.851812  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0217  nitrogen regulatory protein P-II  82.14 
 
 
112 aa  184  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531374  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  82.14 
 
 
112 aa  185  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  82.14 
 
 
112 aa  184  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 
112 aa  183  7e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03567  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 
114 aa  183  7e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.918332  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 
112 aa  182  1e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0156  nitrogen regulatory protein P-II  83.04 
 
 
112 aa  182  1e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3656  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 
112 aa  182  2e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 
112 aa  181  2e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  80.36 
 
 
112 aa  181  4e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1663  nitrogen regulatory protein P-II  83.04 
 
 
112 aa  180  5e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.824699  normal  0.572812 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2346  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  78.57 
 
 
112 aa  179  9e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.235899 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1116  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  179  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2043  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 
112 aa  178  2e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.242523  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 
112 aa  178  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0173  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  177  4e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  2.93377e-06  normal  0.353092 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 
112 aa  176  1e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00479  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  175  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0912  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  75.89 
 
 
112 aa  175  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  4.42242e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  174  3e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  174  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1130  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  174  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  173  6e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  8.92392e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0626  nitrogen regulatory protein  74.11 
 
 
112 aa  173  8e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0642  nitrogen regulatory protein  74.11 
 
 
112 aa  173  8e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3772  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  172  1e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.762526 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  172  1e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0683  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  172  1e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0623  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  171  2e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000846933  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2168  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 
112 aa  172  2e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  2.16085e-05  hitchhiker  7.91345e-07 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  76.79 
 
 
112 aa  172  2e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1545  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  171  2e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0641  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  171  2e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252116  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0995  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  171  2e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.882952  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0491  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  172  2e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0797  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  171  4e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.131267  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1118  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  171  4e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1123  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  171  4e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.727128  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3650  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  171  4e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.107893  hitchhiker  0.000239042 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1089  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  171  4e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.101953  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3708  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  171  4e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00803334  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3832  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  171  4e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00851971  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  170  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  170  5e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  2.57329e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0135  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
121 aa  170  5e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.14835e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3241  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  170  6e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>