14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5881 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5881  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  376  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717536  normal  0.487287 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1369  hypothetical protein  29.19 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.294932  normal  0.453286 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2065  hypothetical protein  29.9 
 
 		 198 aa  89.7  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1088  hypothetical protein  24.74 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.047449  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1611  hypothetical protein  23.12 
 
 		 200 aa  67  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000477853  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2058  hypothetical protein  23.08 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000110329  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1825  putative membrane protin  22.56 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1760  hypothetical protein  27.32 
 
 		 197 aa  57  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000219009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35270  hypothetical protein  18.56 
 
 		 409 aa  55.5  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1385  hypothetical protein  23.74 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000578714  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01157  hypothetical protein  20.1 
 
 		 402 aa  47.4  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_35977  predicted protein  21.9 
 
 		 551 aa  45.1  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.586118  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05560  hypothetical protein  19.07 
 
 		 201 aa  42.7  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.15855e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3051  hypothetical protein  17.17 
 
 		 409 aa  41.2  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>