262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0707 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0707  protein of unknown function DUF161  100 
 
 
296 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0826  permease  56.79 
 
 
322 aa  327  1.0000000000000001e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.668966  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01860  hypothetical protein  50.9 
 
 
323 aa  294  2e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.415337  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3548  protein of unknown function DUF161  51.8 
 
 
287 aa  249  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.979757 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1588  Protein of unknown function DUF2179  48.79 
 
 
289 aa  241  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal  0.342251 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0624  hypothetical protein  46.67 
 
 
282 aa  228  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.594399  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1207  protein of unknown function DUF161  36.49 
 
 
294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.772174  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2267  protein of unknown function DUF161  41.09 
 
 
299 aa  187  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000155206  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3010  hypothetical protein  35.59 
 
 
292 aa  169  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0879703  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0836  hypothetical protein  37.63 
 
 
292 aa  162  7e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00175288  hitchhiker  0.00000155404 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4135  hypothetical protein  36.61 
 
 
292 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0943435  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4400  hypothetical protein  37.29 
 
 
292 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0817  hypothetical protein  34.43 
 
 
287 aa  159  4e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0167  Protein of unknown function DUF2179  33.67 
 
 
293 aa  156  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4362  hypothetical protein  36.27 
 
 
292 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0124376  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4184  hypothetical protein  36.27 
 
 
292 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.151  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4022  hypothetical protein  36.27 
 
 
292 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000230064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4506  hypothetical protein  36.27 
 
 
292 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0062877  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4304  YqfU  36.27 
 
 
292 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75009e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4416  hypothetical protein  35.93 
 
 
292 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000589222  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4032  hypothetical protein  35.93 
 
 
292 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00528347  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0203  hypothetical protein  32.03 
 
 
278 aa  151  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5091  yitT family protein  31.67 
 
 
278 aa  149  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0210  yitT family protein  31.34 
 
 
278 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0196  hypothetical protein  31.34 
 
 
278 aa  149  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.851419  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0200  hypothetical protein  31.34 
 
 
278 aa  149  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0218  yitT family protein  31.34 
 
 
278 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0234  yitT family protein  31.34 
 
 
278 aa  149  7e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.347632  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0253  yitT family protein  31.34 
 
 
278 aa  149  7e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0235  yitT family protein  31.32 
 
 
278 aa  148  9e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.673313  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0196  hypothetical protein  31.21 
 
 
278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0228  yitT family protein  31.21 
 
 
278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4939  hypothetical protein  33.21 
 
 
290 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4925  hypothetical protein  31.86 
 
 
290 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0314  hypothetical protein  33.21 
 
 
290 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4955  hypothetical protein  31.53 
 
 
290 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891963  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4634  hypothetical protein  33.21 
 
 
290 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4695  hypothetical protein  32.85 
 
 
290 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4535  hypothetical protein  32.85 
 
 
290 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.371592  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4552  hypothetical protein  32.85 
 
 
290 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5056  hypothetical protein  32.85 
 
 
290 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4920  hypothetical protein  32.85 
 
 
290 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3014  protein of unknown function DUF161  29.92 
 
 
295 aa  138  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000325851  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2134  hypothetical protein  30.64 
 
 
290 aa  136  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2074  hypothetical protein  30.47 
 
 
281 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3231  hypothetical protein  30.47 
 
 
281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.581359 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1662  Protein of unknown function DUF2179  28.68 
 
 
292 aa  126  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16380  hypothetical protein  32.87 
 
 
286 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000759545  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0235  hypothetical protein  31.02 
 
 
281 aa  125  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1219  protein of unknown function DUF161  28.41 
 
 
299 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.929134  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0967  hypothetical protein  32.27 
 
 
281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.69732  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2126  protein of unknown function DUF161  27.54 
 
 
289 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00308608  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1705  hypothetical protein  26.24 
 
 
288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0494  hypothetical protein  28.47 
 
 
298 aa  115  6e-25  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3076  hypothetical protein  27.02 
 
 
283 aa  115  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000401824  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0393  hypothetical protein  30.21 
 
 
290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2675  hypothetical protein  29.86 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000375547  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0389  hypothetical protein  30.8 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0468  Protein of unknown function DUF2179  26.07 
 
 
287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2360  hypothetical protein  29.86 
 
 
285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.411181  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3006  protein of unknown function DUF161  30.56 
 
 
286 aa  112  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000192497  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0072  hypothetical protein  26.69 
 
 
287 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0493  Protein of unknown function DUF2179  27.96 
 
 
290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0760  hypothetical protein  26.28 
 
 
287 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000455591  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2215  protein of unknown function DUF161  29.92 
 
 
294 aa  110  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00368135  hitchhiker  0.000374105 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1889  hypothetical protein  30.47 
 
 
281 aa  109  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00425975  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2115  hypothetical protein  30.47 
 
 
281 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1937  hypothetical protein  30.47 
 
 
281 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1899  hypothetical protein  30.47 
 
 
281 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000397905  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2084  hypothetical protein  30.47 
 
 
281 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.362463  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2169  hypothetical protein  30.11 
 
 
281 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4895  hypothetical protein  27.61 
 
 
311 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000776906  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0305  hypothetical protein  27.11 
 
 
277 aa  107  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1936  hypothetical protein  29.39 
 
 
285 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.464874  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2183  hypothetical protein  30.11 
 
 
281 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1826  hypothetical protein  25.27 
 
 
298 aa  107  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2225  hypothetical protein  28.52 
 
 
309 aa  107  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.22076  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3284  hypothetical protein  31.14 
 
 
279 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.565823  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2954  hypothetical protein  30.77 
 
 
279 aa  106  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.645882  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0958  hypothetical protein  26.55 
 
 
306 aa  106  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5178  hypothetical protein  28.21 
 
 
297 aa  106  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2061  protein of unknown function DUF161  29.86 
 
 
283 aa  106  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.512789  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5163  hypothetical protein  27.86 
 
 
297 aa  105  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4850  hypothetical protein  27.7 
 
 
297 aa  105  8e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3612  hypothetical protein  26.98 
 
 
297 aa  105  9e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3259  hypothetical protein  30.77 
 
 
279 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3033  hypothetical protein  30.77 
 
 
279 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.238411  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4891  hypothetical protein  27.86 
 
 
297 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3014  hypothetical protein  30.77 
 
 
279 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.098054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4733  hypothetical protein  27.86 
 
 
297 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4748  hypothetical protein  27.86 
 
 
297 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5133  hypothetical protein  27.86 
 
 
297 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3266  hypothetical protein  30.77 
 
 
279 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.698402  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5265  hypothetical protein  27.86 
 
 
297 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0594093  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0748  hypothetical protein  26.98 
 
 
283 aa  105  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0644757  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0295  hypothetical protein  28.26 
 
 
285 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0290  hypothetical protein  28.62 
 
 
285 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000120699  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1062  hypothetical protein  26.1 
 
 
333 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1322  hypothetical protein  25.74 
 
 
285 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0771  hypothetical protein  27.7 
 
 
283 aa  104  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.103591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>