More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0551 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0537  leucyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 
826 aa  675    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.993969  normal  0.956377 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf171  leucyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 
804 aa  756    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0481  leucyl-tRNA synthetase  50.65 
 
 
819 aa  836    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.772871  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0194  leucyl-tRNA synthetase  42.7 
 
 
813 aa  673    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.159225  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2209  leucyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 
824 aa  683    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2438  leucyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 
865 aa  677    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000200562  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2339  leucyl-tRNA synthetase  52.47 
 
 
858 aa  875    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000153257  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1318  leucyl-tRNA synthetase  56.25 
 
 
804 aa  949    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0757  leucyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 
824 aa  713    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4419  leucyl-tRNA synthetase  44.46 
 
 
814 aa  701    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4882  leucyl-tRNA synthetase  55.42 
 
 
802 aa  931    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1722  leucyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 
863 aa  640    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2057  leucyl-tRNA synthetase  51.53 
 
 
833 aa  873    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00764641  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0808  leucyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 
860 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3447  leucyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 
874 aa  635    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121594 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4637  leucyl-tRNA synthetase  55.3 
 
 
802 aa  931    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4472  leucyl-tRNA synthetase  55.3 
 
 
802 aa  931    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.947334  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl490  leucyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 
801 aa  773    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4490  leucyl-tRNA synthetase  55.3 
 
 
802 aa  931    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0829  leucyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 
1016 aa  665    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0577341  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0255  leucyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 
816 aa  667    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00083346  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3015  leucyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 
860 aa  637    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.652989  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0665  leucyl-tRNA synthetase  78.3 
 
 
807 aa  1360    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41128  predicted protein  48.28 
 
 
879 aa  795    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.780375  normal  0.100817 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1861  leucyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 
829 aa  680    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.911399  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0938  leucyl-tRNA synthetase  45.86 
 
 
807 aa  734    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2915  leucyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 
815 aa  665    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5765  leucyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 
971 aa  692    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351208  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4570  leucyl-tRNA synthetase  54.98 
 
 
802 aa  922    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4936  leucyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 
872 aa  674    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4535  leucyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 
904 aa  665    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2665  leucyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 
819 aa  663    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.364748  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3415  leucyl-tRNA synthetase  55.21 
 
 
802 aa  933    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1413  leucyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 
851 aa  679    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000816015  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1237  leucyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 
825 aa  720    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1636  leucyl-tRNA synthetase  76.67 
 
 
805 aa  1307    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.494326  normal  0.491966 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2926  leucyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 
860 aa  638    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.454668  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1688  leucyl-tRNA synthetase  75.71 
 
 
805 aa  1314    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2819  leucyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 
832 aa  652    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2300  leucyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 
824 aa  688    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.284228  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2439  leucyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 
829 aa  666    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1522  leucyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 
819 aa  717    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4991  leucyl-tRNA synthetase  55.3 
 
 
802 aa  931    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1865  leucyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 
826 aa  657    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.107054  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1920  leucyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 
865 aa  680    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0598  leucyl-tRNA synthetase  79.63 
 
 
805 aa  1380    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0659  leucyl-tRNA synthetase  47.58 
 
 
804 aa  778    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10040  leucyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 
969 aa  666    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.928861 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0568  leucyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 
829 aa  713    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4197  leucyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 
859 aa  650    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2727  leucyl-tRNA synthetase  41.93 
 
 
858 aa  657    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.354364  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3225  leucyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 
954 aa  720    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14755  normal  0.0283865 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0256  leucyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 
823 aa  703    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1295  leucyl-tRNA synthetase  53.97 
 
 
806 aa  890    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000279205  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3308  leucyl-tRNA synthetase  43.43 
 
 
819 aa  651    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0417159 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0201  leucyl-tRNA synthetase  49.35 
 
 
835 aa  810    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0344  leucyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 
828 aa  668    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.361332  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2744  leucyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 
864 aa  635    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0853  leucyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 
949 aa  682    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0292771 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0780  leucyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 
824 aa  717    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1842  leucyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 
860 aa  637    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2929  leucyl-tRNA synthetase  41.64 
 
 
863 aa  643    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.010661 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1813  leucyl-tRNA synthetase  56 
 
 
805 aa  898    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.682245  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0232  leucyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 
861 aa  642    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0505  leucyl-tRNA synthetase  77.41 
 
 
806 aa  1316    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0567  leucyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 
819 aa  637    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0791746  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1848  leucyl-tRNA synthetase  56 
 
 
805 aa  898    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.164346  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5389  leucyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 
971 aa  692    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852911  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3202  leucyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 
817 aa  657    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1566  leucyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 
870 aa  635    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.408978  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2145  leucyl-tRNA synthetase  43.62 
 
 
817 aa  657    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.736456  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0657  leucyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 
816 aa  669    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0645  leucyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 
816 aa  686    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1557  leucyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 
860 aa  636    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3134  leucyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 
824 aa  686    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01672  leucyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 
867 aa  644    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126917  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1062  leucyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 
859 aa  635    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0109864 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2719  leucyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 
838 aa  656    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0751  leucyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 
824 aa  677    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1599  leucyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 
824 aa  699    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000190725  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0159  leucyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 
813 aa  673    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2515  leucyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 
827 aa  671    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000585626  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0077  leucyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 
904 aa  667    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.622899  hitchhiker  0.0000864885 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0875  leucyl-tRNA synthetase  50.53 
 
 
829 aa  838    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0839  leucyl-tRNA synthetase  53.28 
 
 
829 aa  857    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.435731  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0459  leucyl-tRNA synthetase  54.17 
 
 
804 aa  872    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.0638031 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0635  leucyl-tRNA synthetase  54.58 
 
 
808 aa  913    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0268  leucyl-tRNA synthetase  51.18 
 
 
833 aa  865    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2116  leucyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 
825 aa  702    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0751  leucyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 
860 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2084  leucyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 
829 aa  646    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.276133  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1654  leucyl-tRNA synthetase  50.87 
 
 
857 aa  854    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.119933 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1001  leucyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 
859 aa  637    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.355839  normal  0.124376 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0551  leucyl-tRNA synthetase  74.32 
 
 
806 aa  1285    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.629594 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1731  leucyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 
823 aa  689    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.308382  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0551  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 
816 aa  1696    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3451  leucyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 
952 aa  709    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0150406 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2582  leucyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 
864 aa  642    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.60297 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5478  leucyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 
971 aa  692    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.81609  normal  0.704935 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3868  leucyl-tRNA synthetase  51.57 
 
 
857 aa  843    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579289  normal  0.0597949 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>