18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0158 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0158  ribosomal protein L14E  100 
 
 
104 aa  206  1e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.574976  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0462  50S ribosomal protein L14e  64.44 
 
 
98 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0053  50S ribosomal protein L14e  64.95 
 
 
103 aa  133  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0079  50S ribosomal protein L14e  60.78 
 
 
103 aa  131  3e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.149247 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1127  50S ribosomal protein L14e  58.82 
 
 
103 aa  130  5e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000887763 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0088  50S ribosomal protein L14e  63.16 
 
 
103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0055  50S ribosomal protein L14e  59.34 
 
 
96 aa  118  1.9999999999999998e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.464279 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1371  50S ribosomal protein L14  55.32 
 
 
96 aa  115  3e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1498  50S ribosomal protein L14e  51.9 
 
 
77 aa  87.8  4e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1648  50S ribosomal protein L14e  51.9 
 
 
77 aa  87.4  6e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.481236  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1126  50S ribosomal protein L14e  55.13 
 
 
94 aa  86.7  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.404349  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0980  50S ribosomal protein L14e  50.63 
 
 
77 aa  85.5  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0266  50S ribosomal protein L14e  50.63 
 
 
77 aa  85.5  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25577  predicted protein  35.56 
 
 
133 aa  56.6  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01166  60S ribosomal protein L6 (AFU_orthologue; AFUA_1G11130)  33.78 
 
 
198 aa  45.4  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02260  ribosomal protein, putative  33.75 
 
 
139 aa  42  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03060  structural constituent of ribosome, putative  36.21 
 
 
235 aa  40.8  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0217  hypothetical protein  32.1 
 
 
93 aa  40.4  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.934654 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>