34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1404 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1404  protein of unknown function DUF988  100 
 
 
165 aa  325  1.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000940341  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1440  hypothetical protein  40.54 
 
 
152 aa  119  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746936  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1489  protein of unknown function DUF988  38.46 
 
 
157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1233  transporter  43.42 
 
 
151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2273  protein of unknown function DUF988  50 
 
 
160 aa  105  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07380  predicted membrane protein  35.53 
 
 
150 aa  105  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0562759  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0096  hypothetical protein  36.71 
 
 
172 aa  104  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000816189  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0260  protein of unknown function DUF988  40.82 
 
 
163 aa  103  8e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1481  protein of unknown function DUF988  44.3 
 
 
179 aa  102  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.674772  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1496  hypothetical protein  34.64 
 
 
156 aa  95.1  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.327831  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3047  protein of unknown function DUF988  37.16 
 
 
189 aa  92  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1478  hypothetical protein  34.52 
 
 
167 aa  91.3  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00307315  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1749  hypothetical protein  36.2 
 
 
167 aa  90.9  6e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000203551  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1797  transporter  35.29 
 
 
173 aa  80.5  0.000000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1325  protein of unknown function DUF988  34.18 
 
 
208 aa  70.9  0.000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00310144  hitchhiker  0.000548247 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0990  protein of unknown function DUF988  29.68 
 
 
162 aa  62  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.242201  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1514  hypothetical protein  31.51 
 
 
173 aa  61.2  0.000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2119  hypothetical protein  30.07 
 
 
160 aa  60.1  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328262  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1765  protein of unknown function DUF988  29.38 
 
 
161 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0847  hypothetical protein  30.72 
 
 
169 aa  51.6  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000607562  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1509  hypothetical protein  33.33 
 
 
159 aa  50.1  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000920672  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1240  hypothetical protein  26.72 
 
 
185 aa  48.1  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.32555  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0296  hypothetical protein  31.79 
 
 
158 aa  45.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1513  hypothetical protein  25.77 
 
 
162 aa  45.1  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1716  hypothetical protein  24.84 
 
 
161 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.10704  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1767  hypothetical protein  24.84 
 
 
161 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1693  hypothetical protein  24.84 
 
 
161 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1509  hypothetical protein  24.84 
 
 
161 aa  42.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0120587  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1481  hypothetical protein  24.84 
 
 
161 aa  42.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.043733  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1471  hypothetical protein  24.84 
 
 
161 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00963664  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1625  hypothetical protein  24.84 
 
 
161 aa  42.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1662  hypothetical protein  24.84 
 
 
161 aa  42  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1323  hypothetical protein  25.47 
 
 
162 aa  41.6  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000137615  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0849  hypothetical protein  33.73 
 
 
169 aa  40.8  0.008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>