55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0057 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0057  molybdopterin converting factor, subunit 1  100 
 
 
79 aa  147  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116564  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0090  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.17 
 
 
83 aa  54.7  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.320274  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0276  molybdopterin synthase subunit MoaD  39.76 
 
 
83 aa  52.8  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000186467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3746  molybdopterin synthase subunit MoaD  39.76 
 
 
83 aa  52.8  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0503888 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0275  molybdopterin synthase subunit MoaD  39.76 
 
 
83 aa  52.8  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000298217 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4450  molybdenum cofactor biosynthesis protein D  38.55 
 
 
83 aa  51.6  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0103  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.94 
 
 
83 aa  50.4  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00524284  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2280  molydbenum cofactor biosynthesis protein D  43.21 
 
 
75 aa  49.7  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4117  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.55 
 
 
83 aa  50.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4399  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.96 
 
 
83 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0335567  hitchhiker  0.000558782 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4790  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.55 
 
 
83 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000520563  hitchhiker  0.000000143296 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3854  thiamineS protein  45.68 
 
 
95 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.640295  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0391  molybdopterin converting factor, subunit 1  36.14 
 
 
83 aa  47.4  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0931  molybdopterin synthase small subunit  37.04 
 
 
81 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0283  molybdopterin converting factor, subunit 1  36.14 
 
 
83 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0287  molybdopterin converting factor, subunit 1  36.14 
 
 
83 aa  47.4  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0279  molybdopterin converting factor, subunit 1  36.14 
 
 
83 aa  47.4  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0286  molybdopterin converting factor, subunit 1  36.14 
 
 
83 aa  47.4  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2227  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.45 
 
 
83 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00189001 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0926  thiamineS  40.74 
 
 
78 aa  45.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0868  molybdopterin synthase small subunit  35.8 
 
 
81 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0855763  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1242  molybdopterin synthase subunit MoaD  43.33 
 
 
95 aa  44.7  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00579746 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0899  molybdopterin synthase small subunit  35.8 
 
 
81 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0329  molybdopterin converting factor, subunit 1  36.36 
 
 
224 aa  44.7  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00555526  decreased coverage  0.00329133 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1279  molybdopterin converting factor, subunit 1  36.59 
 
 
83 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.287689  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0954  molybdopterin synthase small subunit  34.57 
 
 
81 aa  42.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0840  molybdopterin synthase small subunit  34.57 
 
 
81 aa  42.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1587  molybdopterin converting factor, subunit 1  36.71 
 
 
77 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1175  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.37 
 
 
83 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.421985  normal  0.228216 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2156  thiamineS  33.33 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0674186  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0932  molybdopterin synthase small subunit  37.04 
 
 
81 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2168  molybdopterin converting factor, subunit 1  31.71 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4637  molybdopterin converting factor, subunit 1  29.31 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2194  molybdopterin synthase subunit MoaD  40.32 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000704898  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2834  molybdopterin synthase small subunit  34.15 
 
 
81 aa  41.6  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.794895  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3202  molybdopterin synthase subunit MoaD  37.97 
 
 
87 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.262131  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2555  molybdopterin converting factor, subunit 1  37.97 
 
 
87 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1436  molybdopterin synthase small subunit  34.15 
 
 
81 aa  41.6  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2920  molybdopterin synthase small subunit  34.15 
 
 
81 aa  41.6  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0847  molybdopterin synthase small subunit  35.8 
 
 
81 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.277735  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00751  molybdopterin synthase, small subunit  35.8 
 
 
81 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00768  hypothetical protein  35.8 
 
 
81 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0807  molybdopterin synthase small subunit  35.8 
 
 
81 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0028903  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0903  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.02 
 
 
83 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2341  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.04 
 
 
83 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12358  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0478  molybdopterin converting factor, subunit 1  35.44 
 
 
86 aa  40.8  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2568  molybdopterin synthase small subunit  34.57 
 
 
81 aa  40.4  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0481357  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2859  molybdopterin synthase small subunit  34.57 
 
 
81 aa  40.4  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512305  hitchhiker  0.00418424 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3527  molybdenum cofactor biosynthesis protein D  30.12 
 
 
83 aa  40.4  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2858  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.57 
 
 
81 aa  40.4  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0838  molybdopterin synthase small subunit  34.57 
 
 
81 aa  40.4  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02446  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.47 
 
 
77 aa  40.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1916  molybdopterin converting factor, subunit 1  40 
 
 
83 aa  40.4  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1323  molybdopterin synthase small subunit  34.57 
 
 
81 aa  40.4  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.444725  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1545  molybdopterin synthase subunit MoaD  44.83 
 
 
84 aa  40  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>