150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2156 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2156  thiamineS  100 
 
 		 81 aa  165  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0674186  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0847  molybdopterin synthase small subunit  50.62 
 
 		 81 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.277735  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4117  molybdopterin converting factor, subunit 1  46.99 
 
 		 83 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0275  molybdopterin synthase subunit MoaD  46.99 
 
 		 83 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000298217 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3746  molybdopterin synthase subunit MoaD  46.99 
 
 		 83 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0503888 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0276  molybdopterin synthase subunit MoaD  46.99 
 
 		 83 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000186467 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4450  molybdenum cofactor biosynthesis protein D  46.99 
 
 		 83 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0283  molybdopterin converting factor, subunit 1  46.99 
 
 		 83 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0391  molybdopterin converting factor, subunit 1  46.99 
 
 		 83 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0286  molybdopterin converting factor, subunit 1  46.99 
 
 		 83 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0279  molybdopterin converting factor, subunit 1  46.99 
 
 		 83 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0287  molybdopterin converting factor, subunit 1  46.99 
 
 		 83 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00751  molybdopterin synthase, small subunit  49.38 
 
 		 81 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00768  hypothetical protein  49.38 
 
 		 81 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0807  molybdopterin synthase small subunit  49.38 
 
 		 81 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0028903  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2858  molybdopterin converting factor, subunit 1  48.15 
 
 		 81 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2568  molybdopterin synthase small subunit  48.15 
 
 		 81 aa  72.8  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0481357  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0090  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.78 
 
 		 83 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.320274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0838  molybdopterin synthase small subunit  48.15 
 
 		 81 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0932  molybdopterin synthase small subunit  48.15 
 
 		 81 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2859  molybdopterin synthase small subunit  48.15 
 
 		 81 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512305  hitchhiker  0.00418424 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0103  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.76 
 
 		 83 aa  72  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00524284  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4399  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.58 
 
 		 83 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0335567  hitchhiker  0.000558782 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3527  molybdenum cofactor biosynthesis protein D  44.58 
 
 		 83 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4790  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.37 
 
 		 83 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000520563  hitchhiker  0.000000143296 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1515  molybdopterin synthase small subunit  43.21 
 
 		 81 aa  69.7  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1879  molybdopterin synthase small subunit  44.44 
 
 		 81 aa  69.7  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2432  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.44 
 
 		 81 aa  68.2  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.554739  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0547  molybdopterin synthase small subunit  48.15 
 
 		 81 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2949  molybdopterin synthase small subunit  41.98 
 
 		 81 aa  67.4  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.446076  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0954  molybdopterin synthase small subunit  43.21 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0840  molybdopterin synthase small subunit  43.21 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2523  molybdopterin converting factor, subunit 1  41.98 
 
 		 81 aa  63.9  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2834  molybdopterin synthase small subunit  40.74 
 
 		 81 aa  63.9  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.794895  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1436  molybdopterin synthase small subunit  40.74 
 
 		 81 aa  63.9  0.0000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2920  molybdopterin synthase small subunit  40.74 
 
 		 81 aa  63.9  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107943  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0931  molybdopterin synthase small subunit  41.98 
 
 		 81 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0868  molybdopterin synthase small subunit  41.98 
 
 		 81 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0855763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0899  molybdopterin synthase small subunit  41.98 
 
 		 81 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1029  molybdopterin synthase small subunit  38.27 
 
 		 81 aa  62.4  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1323  molybdopterin synthase small subunit  40.74 
 
 		 81 aa  62.4  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.444725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0084  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.24 
 
 		 82 aa  61.2  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2168  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.17 
 
 		 83 aa  61.6  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1276  molybdopterin synthase small subunit  43.21 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.116417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1242  molybdopterin synthase subunit MoaD  35.8 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579746 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2146  thiamineS  33.73 
 
 		 83 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2078  GTP cyclohydrolase subunit MoaC  42.17 
 
 		 262 aa  58.2  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00767498  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2227  molybdopterin converting factor, subunit 1  37.04 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189001 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4637  molybdopterin converting factor, subunit 1  37.8 
 
 		 82 aa  57  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02951  molybdopterin synthase small subunit  43.53 
 
 		 85 aa  57  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1267  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.76 
 
 		 85 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.782694  normal  0.789064 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1206  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.76 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0937261  normal  0.054549 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5215  molybdopterin converting factor, subunit 1  35.8 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.532567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03858  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.55 
 
 		 81 aa  56.6  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2524  molybdopterin converting factor, subunit 1  36.59 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.906583  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2194  molybdopterin synthase subunit MoaD  34.57 
 
 		 83 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000704898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2021  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.57 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002957  molybdenum cofactor biosynthesis protein D  41.18 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1262  molybdopterin synthase subunit MoaD  39.76 
 
 		 83 aa  54.7  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1916  molybdopterin converting factor, subunit 1  33.33 
 
 		 83 aa  53.9  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1990  molybdopterin synthase subunit MoaD  38.1 
 
 		 85 aa  53.5  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163158  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1331  molybdopterin MPT converting factor subunit 1  36.14 
 
 		 87 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2609  molybdopterin synthase subunit MoaD  39.02 
 
 		 88 aa  53.5  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.503045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0478  molybdopterin converting factor, subunit 1  35.8 
 
 		 86 aa  53.5  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1963  molybdopterin synthase subunit MoaD  37.35 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000246568  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2555  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.57 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3202  molybdopterin synthase subunit MoaD  34.57 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.262131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1068  molybdopterin converting factor, subunit 1:MoaD_  35 
 
 		 81 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.679928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2667  molybdopterin converting factor, subunit 1  32.1 
 
 		 83 aa  51.6  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0934  molybdopterin converting factor, subunit 1  33.73 
 
 		 85 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1180  molybdopterin converting factor, subunit 1  32.5 
 
 		 217 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0049  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.12 
 
 		 85 aa  50.8  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.372094  normal  0.038517 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3054  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.27 
 
 		 77 aa  50.8  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1248  molybdopterin converting factor, subunit 1  32.5 
 
 		 217 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.460975  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0210  molybdopterin converting factor, subunit 1  35 
 
 		 76 aa  50.1  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2170  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.55 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1789  molybdopterin converting factor, subunit 1  36.14 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1761  molybdopterin converting factor, subunit 1  36.14 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.336452 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1835  molybdopterin converting factor, subunit 1  29.63 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1248  molybdenum cofactor biosynthesis protein D  35 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1989  molybdopterin converting factor subunit 1  37.35 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0155681  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0159  molybdopterin converting factor, subunit 1  32.53 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000222871  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2137  molybdopterin converting factor subunit 1  37.35 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1875  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.94 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.306634  hitchhiker  0.0000380608 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1586  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.51 
 
 		 82 aa  49.7  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1941  molybdopterin biosynthesis protein, subunit D  34.57 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1026  molybdopterin synthase subunit MoaD  35.37 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00122387 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5152  molybdopterin synthase subunit MoaD  34.94 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13240  molybdopterin converting factor, small subunit  33.73 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.494313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0441  molybdopterin converting factor, subunit 1  32.53 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1191  molybdopterin converting factor small subunit  33.73 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1035  molybdopterin synthase subunit MoaD  32.1 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.964546 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6228  molybdopterin converting factor, subunit 1  33.73 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1851  molybdopterin converting factor, subunit 1  33.73 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1422  molybdopterin converting factor, subunit 1  32.53 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0783343  hitchhiker  0.00713851 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2201  molybdopterin converting factor, subunit 1  32.53 
 
 		 87 aa  47.8  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00732889  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1293  molybdopterin converting factor, subunit 1  31.25 
 
 		 82 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.202321  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1963  molybdopterin biosynthesis protein, subunit D  34.57 
 
 		 77 aa  47.4  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4432  molybdopterin converting factor, subunit 1  31.25 
 
 		 81 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1160  molybdopterin converting factor, subunit 1  33.75 
 
 		 223 aa  47.4  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.60051 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>